基因表达时序分析

北检院检测中心  |  完成测试:  |  2025-12-26  

基因表达时序分析通过测定不同时间点的基因表达水平,揭示生物过程的动态调控网络。该分析涉及RNA提取质量评估、高通量测序数据处理、差异表达基因鉴定以及时间序列模式聚类等关键环节。技术核心在于确保数据的时间分辨率和生物学重复的可靠性,以准确捕捉转录组随时间的变化规律。

注意:因业务调整,暂不接受个人委托测试望见谅。

检测项目

总RNA提取与质量评估:对生物样本在不同时间点进行总RNA分离,并通过完整性数值和纯度指标评估样本质量,确保下游分析数据的可靠性。

信使RNA文库构建:利用寡核苷酸探针从总RNA中富集含有polyA尾的信使RNA片段,并完成cDNA合成与接头连接,为高通量测序制备标准化文库。

小规模核糖核酸测序分析:对长度在18至30个核苷酸之间的非编码RNA进行深度测序,揭示其在时序调控过程中的表达变化与潜在功能。

高通量转录组测序:采用下一代测序技术对特定时间点的全部转录本进行无偏倚测定,获得全基因组范围内的基因表达定量数据。

原始测序数据质量控制:对测序产生的原始数据进行过滤,剔除低质量读段和接头序列,评估测序错误率与GC含量分布等关键质量参数。

参考基因组序列比对:将高质量测序读段与相应物种的参考基因组进行精准比对,确定每个读段在基因组上的位置信息用于后续定量分析。

基因表达水平定量:基于比对结果统计映射到每个基因外显子区域的读段数目,计算得到标准化后的基因表达量如FPKM或TPM值。

差异表达基因分析:运用统计学模型比较不同时间点之间的基因表达量,识别在特定时间窗口内表达水平发生显著变化的基因集合。

时间序列表达模式聚类:对差异表达基因的表达动力学曲线进行无监督聚类分析,识别具有相似时间变化趋势的共表达基因模块。

基因功能富集分析:对每个共表达基因模块进行基因本体论和京都基因与基因组百科全书通路分析,阐释其参与的生物学过程与代谢通路。

检测范围

动物组织样本:涵盖啮齿类动物器官组织在不同发育阶段或疾病模型中的基因表达动态变化研究。

植物生长发育研究:应用于农作物从种子萌发到开花结果全生命周期中关键调控基因的时序性鉴定。

细胞系体外培养模型:针对药物处理或诱导分化过程中细胞转录组随时间演变的精细刻画。

检测流程

线上咨询或者拨打咨询电话;

获取样品信息和检测项目;

支付检测费用并签署委托书;

开展实验,获取相关数据资料;

出具检测报告。

北检(北京)检测技术研究院
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