转录组差异表达检测

北检院检测中心  |  完成测试:  |  2025-12-31  

转录组差异表达检测通过高通量测序技术,分析不同条件下细胞或组织样本中基因表达水平的变化。该检测涵盖RNA提取、文库构建、上机测序及生物信息学分析全流程,重点在于确保数据质量、筛选差异表达基因并进行功能注释,为生命科学研究提供关键数据支撑。

注意:因业务调整,暂不接受个人委托测试望见谅。

检测项目

总RNA提取与质量评估:采用专用试剂盒从样本中分离完整的总RNA,并通过微量分光光度计和自动化电泳系统对RNA的浓度、纯度及完整性进行精确测定。

mRNA富集与文库构建:利用寡核苷酸探针或酶学法选择性富集真核生物mRNA,随后进行片段化、逆转录、末端修复及接头连接,制备适用于高通量测序的cDNA文库。

测序平台运行与数据产出

原始测序数据质量控制:对下机产生的原始测序数据进行质量评估,包括碱基质量分布、GC含量、接头污染及重复序列比例等多项指标的分析。

序列比对与定位分析:将高质量测序读段通过比对算法映射至参考基因组或转录组,计算基因或转录本的覆盖度及比对率等统计参数。

基因表达定量分析:基于比对结果,采用计数软件统计每个基因或转录本的读段数目,并进行标准化处理以获得可靠的基因表达量矩阵。

差异表达基因筛选:运用统计学模型比较不同实验条件下的基因表达水平,识别表达量存在显著变化的基因列表并计算其倍数变化和校正后P值。

聚类分析与可视化呈现:对差异表达基因进行层次聚类或主成分分析,并通过热图、火山图等图形化方式展示样本间关系及基因表达模式。

GO功能与KEGG通路富集分析:将差异表达基因映射至Gene Ontology数据库和KEGG通路数据库,系统性分析其参与的生物学过程、分子功能及信号转导途径。

蛋白质互作网络构建: 基于STRING等数据库预测差异表达基因编码蛋白之间的相互作用关系,构建网络图以揭示核心调控节点和功能模块。

检测范围

动物组织样本: 适用于哺乳动物、鸟类、鱼类等多种动物的器官组织如肝脏、脑组织、肌肉等的转录组差异表达研究。

检测流程

线上咨询或者拨打咨询电话;

获取样品信息和检测项目;

支付检测费用并签署委托书;

开展实验,获取相关数据资料;

出具检测报告。

北检(北京)检测技术研究院
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