分子动力学模拟验证

北检院检测中心  |  完成测试:  |  2026-01-05  

分子动力学模拟验证是评估计算模型准确性和可靠性的关键环节。该过程涉及对模拟力场参数、算法实现以及结果物理意义的系统性检验。验证工作确保模拟能够复现实验观测或理论预测的关键特性,为材料设计、药物研发等领域的应用提供可信的计算依据。

注意:因业务调整,暂不接受个人委托测试望见谅。

检测项目

能量守恒性验证:检查模拟过程中体系总能量随时间的变化情况,确保数值积分算法的稳定性与能量漂移在可接受范围内。

径向分布函数比对:将模拟计算得到的粒子间径向分布函数与中子散射或X射线衍射实验数据进行定量对比,验证液体或无定形体系结构的准确性。

扩散系数计算验证:通过分析粒子均方位移曲线,计算体系的扩散系数,并与实验测量值或已知理论值进行比较。

体系平衡状态判定:监测势能、动能、温度、压力等热力学量随时间演化,判断体系是否达到平衡态,确保后续采样分析的有效性。

压力张量验证:计算体系的维里压力,并与设定的目标压力进行比较,评估等压系综模拟中压力控制的准确性。

界面性质模拟验证:对于包含界面的体系,验证界面张力、密度剖面等性质的模拟结果与实验值或经典理论是否一致。

氢键动力学分析验证:分析水溶液或生物大分子体系中氢键的形成寿命和数量,与光谱学实验观测结果进行对照。

蛋白质构象稳定性验证:通过长时间模拟检验蛋白质骨架原子均方根偏差和回转半径的稳定性,判断折叠构象的合理性。

自由能计算验证:采用热力学积分或自由能微扰等方法计算结合自由能或溶剂化自由能,并与实验测定的热力学数据进行比较。

非平衡分子动力学验证:施加剪切场或温度梯度,验证粘滞系数、热导率等输运性质的计算结果是否符合实际材料的特性。

检测范围

生物大分子体系:包括蛋白质、核酸、多糖及其复合物在水溶液环境下的结构动态、相互作用与功能机理研究。

药物小分子与靶标相互作用:针对候选药物分子与酶、受体等生物大分子的结合模式、亲和力及动力学过程进行模拟分析。

检测流程

线上咨询或者拨打咨询电话;

获取样品信息和检测项目;

支付检测费用并签署委托书;

开展实验,获取相关数据资料;

出具检测报告。

北检(北京)检测技术研究院
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