基因敲低效率分析

北检院检测中心  |  完成测试:  |  2025-12-25  

基因敲低效率分析是评估RNA干扰技术有效性的核心环节,通过定量检测特定基因在mRNA或蛋白水平的表达降低程度。该分析涉及严谨的实验设计、精确的样本处理以及多种分子生物学技术的联合应用,以确保数据的准确性和可重复性,为功能基因组学研究提供关键数据支持。

注意:因业务调整,暂不接受个人委托测试望见谅。

检测项目

siRNA/shRNA序列设计与筛选:针对目标基因设计多条干扰序列并进行初步筛选,评估不同序列的潜在敲低效果,以选择高效且特异性强的候选序列进行后续实验。

细胞转染/病毒感染效率评估:在正式进行基因敲低实验前,需先评估将外源核酸物质导入目标细胞的效率,确保干扰元件能够有效进入细胞,这是获得可靠敲低结果的前提。

实时荧光定量PCR检测:通过qRT-PCR技术定量分析目标基因在mRNA水平的表达变化,计算敲低效率,该方法灵敏度高、定量准确,是评估转录水平敲低效果的标准方法。

蛋白质印迹分析:利用Western Blot技术检测目标基因在蛋白质水平的表达量变化,直接从功能分子层面验证敲低效果,是mRNA水平检测的重要补充。

免疫荧光染色分析:通过特异性抗体标记和荧光显微镜观察,在单细胞水平上直观显示目标蛋白的表达定位和丰度变化,并可进行半定量分析。

酶联免疫吸附测定:采用ELISA方法对细胞培养上清液或细胞裂解液中的特定蛋白质进行定量检测,适用于高通量筛选和可溶性蛋白的敲低效率分析。

细胞表型变化观察:在确认基因敲低效率的基础上,进一步观察和分析细胞增殖、凋亡、周期、迁移等相关表型的变化,建立基因功能与表型的联系。

脱靶效应评估:通过全转录组测序或特定信号通路关键分子检测,分析基因敲除操作是否影响了非目标基因的表达,评估实验的特异性。

敲低持续性监测:在不同时间点(如转染后24小时、48小时、72小时)多次检测目标基因的表达水平,评估敲低效果的持续时间及其动力学特征。

阳性与阴性对照设置验证:设立有效的阳性对照和阴性对照,确保实验体系正常工作,并用于校正和验证本次实验结果的可靠性。

检测范围

肿瘤细胞系:适用于各类常见及罕见的肿瘤细胞系,用于研究癌基因或抑癌基因功能及其在肿瘤发生发展中的作用机制。

原代培养细胞:包括从动物或人体组织直接分离培养的各类原代细胞,用于在更接近体内环境的模型中研究基因功能。

干细胞:涵盖胚胎干细胞、诱导多能干细胞及成体干细胞等,用于研究特定基因在维持干细胞干性、定向分化过程中的关键作用。

动物模型组织样本:从小鼠、大鼠、斑马鱼等模式生物的实验模型中获取的组织样本,用于在体评估基因敲低后的生理病理变化。

植物组织与细胞:适用于拟南芥、水稻等模式植物或其愈伤组织、原生质体,用于植物功能基因组学相关研究。

病毒载体包装系统:基于慢病毒、腺相关病毒等病毒载体的shRNA递送系统,用于实现难转染细胞的稳定基因敲低。

非编码RNA研究:针对长链非编码RNA、环状RNA等非编码RNA分子的功能探索,分析其敲低对下游基因网络的影响。

药物靶点验证:在药物研发初期,通过敲低候选药物靶点基因,验证其与疾病表型的因果关系,为靶向药物开发提供依据。

信号通路解析:通过特异性敲低信号通路中的关键节点基因,解析通路上下游关系及交叉对话,深入理解细胞信号转导网络。

疾病模型构建:通过在小鼠等模式生物中条件性敲低特定基因,模拟人类特定疾病的病理状态,用于疾病机制研究和治疗策略评估。

检测标准

ISO 17025:2017 检测和校准实验室能力的通用要求

GB/T 27401-2008 实验室质量控制规范 分子生物学检测

GB/T 37871-2019 核酸靶标定量测定程序指南

MIQE指南(实时荧光定量PCR实验最低信息量指南)

ISO 20395:2019 生物技术-用于检测特定核酸序列的要求和方法评价

检测仪器

实时荧光定量PCR仪:该仪器通过监测PCR反应过程中荧光信号的累积实现对起始模板的绝对或相对定量,在本检测中用于精确测定目标基因mRNA的表达量变化。

蛋白免疫印迹成像系统:该系统通过化学发光或荧光检测方式对Western Blot膜上的目标蛋白条带进行成像和光密度定量,在本检测中用于分析蛋白质水平的敲低效率。

倒置荧光显微镜:该显微镜配备荧光光源和相应的滤光片系统,可用于观察培养的活细胞或固定细胞,在本检测中主要用于观察免疫荧光染色结果和细胞形态学变化。

酶标仪:该仪器能够对微孔板中的样品进行吸光度、荧光或化学发光信号的快速检测,在本检测中主要用于进行ELISA实验的数据读取和高通量筛选。

核酸蛋白浓度测定仪:该仪器采用紫外吸光度原理快速准确地测量微量核酸或蛋白质样品的浓度和纯度,在本检测中用于对提取的RNA、DNA和蛋白质样品进行质量控制和浓度标准化。

检测流程

线上咨询或者拨打咨询电话;

获取样品信息和检测项目;

支付检测费用并签署委托书;

开展实验,获取相关数据资料;

出具检测报告。

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