质粒拷贝数稳定性分析
北检院检测中心 | 完成测试:次 | 2025-12-26
注意:因业务调整,暂不接受个人委托测试望见谅。
检测项目
质粒DNA定量分析:通过紫外分光光度法或荧光染料法精确测定样品中质粒DNA的绝对浓度,为拷贝数计算提供基础数据。
宿主细胞基因组DNA定量:测定与质粒共提取的宿主基因组DNA含量,用于标准化质粒拷贝数,消除细胞数量差异带来的误差。
实时荧光定量PCR分析:利用特异性引物和探针分别扩增质粒上的特异性序列和宿主基因组单拷贝基因,通过比较Ct值计算每个细胞内的平均质粒拷贝数。
数字PCR绝对定量分析:将样品分割成数万个微反应单元进行PCR扩增,通过直接计数阳性微滴数目实现无需标准曲线的绝对定量,具有极高精度。
传代稳定性试验:将携带质粒的工程菌株在非选择性培养基中进行连续传代培养,定期取样分析拷贝数变化,评估其遗传稳定性。
分裂稳定性评估:通过平板划线法统计在一定传代次数后仍保留质粒的菌落比例,直观反映质粒在细胞分裂过程中的丢失率。
:在不同培养条件下监测工程菌株的生长曲线,分析高拷贝数质粒对宿主细胞生长可能产生的代谢负担。
:考察在不同亚抑制浓度的抗生素压力下,质粒拷贝数的维持情况,模拟实际发酵过程中的选择压力变化。
:通过限制性内切酶图谱分析或全序列测序,确认在长期传代过程中质粒是否发生缺失、重排等结构性变异。
:测定报告基因或目的基因的表达产物量,分析与质粒拷贝数之间的线性关系,验证拷贝数对产量的实际影响。
检测范围
:适用于基于ColE1或pUC复制子的克隆载体,这些载体在大肠杆菌中通常具有较高的基础拷贝数。
:适用于基于p15A或SC101复制子的表达载体,其拷贝数较低但更稳定,常用于表达有毒或不稳定蛋白。