生物信息学预测验证

北检院检测中心  |  完成测试:  |  2025-12-26  

生物信息学预测验证是通过计算方法和实验数据对生物信息学分析结果的可靠性进行评估的过程。该过程涉及序列分析、结构预测、功能注释等多个方面,确保预测模型的准确性和生物学意义。验证环节包括对算法性能的评估、数据质量的把控以及结果的可重复性检验。

注意:因业务调整,暂不接受个人委托测试望见谅。

检测项目

蛋白质三维结构预测验证:通过比对预测结构与实验测定结构,评估模型在空间构象、氨基酸侧链取向等方面的准确性。

基因功能注释准确性验证:利用已知功能的基因数据库作为金标准,检验自动注释工具对新序列功能预测的精确度和召回率。

非编码RNA二级结构预测验证:采用化学探针修饰或酶切实验数据,验证计算软件对RNA分子碱基配对情况的预测结果。

蛋白质-蛋白质相互作用网络预测验证:通过酵母双杂交、免疫共沉淀等体外实验证据,评估计算方法推断的互作关系的可靠性。

单核苷酸多态性功能影响预测验证:结合群体遗传学数据和临床表型信息,检验算法对SNP是否导致有害突变的判断能力。

转录因子结合位点识别验证:使用染色质免疫沉淀测序技术获得的数据,验证motif发现算法预测的结合位点特异性。

宏基因组学分箱结果验证:通过单细胞基因组测序或荧光原位杂交技术,确认计算分箱所得基因组草图的物种来源和完整性。

药物靶点亲和力预测验证:采用表面等离子共振或等温滴定量热法测定结合常数,与计算机模拟的对接打分进行相关性分析。

细胞信号通路富集分析验证:利用基因敲除或过表达实验的功能研究结果,评估通路富集分析得出的生物学结论的有效性。

进化树拓扑结构可靠性验证:应用自举法或贝叶斯后验概率等统计方法,检验系统发育树分支节点的支持度。

检测范围

全基因组测序数据:涵盖人类、动物、植物及微生物等多种生物体的全基因组重测序或denovo组装数据。

转录组测序数据:包括mRNA-seq、smallRNA-seq等不同建库方式的基因表达定量和差异分析结果。

蛋白质组质谱数据:涉及基于液相色谱-质谱联用技术鉴定到的肽段和蛋白质定性定量信息。

表观基因组学数据:包含DNA甲基化测序、染色质可及性测定等表观遗传修饰的基因组分布图谱。

代谢组学谱图数据:指通过核磁共振或质谱技术检测到的细胞内小分子代谢物的定性与定量数据。

检测流程

线上咨询或者拨打咨询电话;

获取样品信息和检测项目;

支付检测费用并签署委托书;

开展实验,获取相关数据资料;

出具检测报告。

北检(北京)检测技术研究院
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