染色质可及性变化分析

北检院检测中心  |  完成测试:  |  2025-12-27  

染色质可及性分析是表观遗传学研究的关键环节,用于评估染色质DNA的物理开放程度及其与调控蛋白的结合能力。该分析通过识别基因组中易于接近的区域,揭示基因调控元件的活性状态。核心检测技术包括ATAC-seq、DNase-seq等,需严格控制实验条件与数据分析流程以确保结果的准确性与可重复性。

注意:因业务调整,暂不接受个人委托测试望见谅。

检测项目

ATAC-seq分析:利用转座酶高通量测序技术检测染色质开放区域,适用于少量细胞样本的表观基因组图谱构建。

DNaseI超敏感位点测序:通过DNaseI酶解开放的染色质区域并进行测序,用于鉴定基因组范围内的调控元件。

MNase-seq分析:使用微球菌核酸酶消化染色质,主要富集核小体保护的DNA片段,用于研究核小体定位。

FAIRE-seq分析:基于甲醛交联与染色质片段化后开放区域DNA的酚氯抽提特性,分离并分析无核小体区域。

NOMe-seq分析:结合核小体定位与DNA甲基化检测,可在单分子水平同时分析染色质可及性与甲基化状态。

ChIP-seq联合分析:将染色质免疫共沉淀与可及性数据整合,研究特定转录因子或组蛋白修饰与染色质开放性的关联。

单细胞ATAC-seq分析:在单个细胞水平解析染色质可及性异质性,揭示细胞群体中的表观遗传差异。

全基因组DNA甲基化关联分析:探讨DNA甲基化模式与染色质开放状态之间的相互作用与调控关系。

核小体占位率计算:通过计算特定基因组区域被核小体覆盖的程度,定量评估该区域的开放性水平。

Tn5转座酶活性测定:评估ATAC-seq实验中所用转座酶的切割效率,确保文库构建的质量可控性。

检测范围

动物组织样本:适用于从小鼠、大鼠等模式生物中提取的各类新鲜或冷冻组织样本的染色质状态研究。

植物组织样本:涵盖拟南芥、水稻等植物的根、茎、叶等组织,用于植物表观遗传学与发育生物学研究。

培养细胞系:包括HEK293、HeLa、K562等多种贴壁或悬浮培养的哺乳动物细胞系的可及性分析。

检测流程

线上咨询或者拨打咨询电话;

获取样品信息和检测项目;

支付检测费用并签署委托书;

开展实验,获取相关数据资料;

出具检测报告。

北检(北京)检测技术研究院
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