项目数量-9
植物病原互作转录组分析
北检院检测中心 | 完成测试：次 | 2025-12-27
植物病原互作转录组分析通过高通量测序技术，揭示植物与病原物相互作用过程中的全基因组表达谱变化。该分析涵盖RNA提取、文库构建、测序及生物信息学分析等关键环节，旨在鉴定差异表达基因、信号通路及关键调控因子，为抗病机理研究和育种策略提供分子层面的数据支持。
注意：因业务调整，暂不接受个人委托测试望见谅。
检测项目
总RNA提取与质量检测：从植物-病原物互作样品中分离完整且无降解的总RNA，利用生物分析仪评估RNA完整性指数和纯度，确保后续测序数据的可靠性。
mRNA富集与文库构建：通过oligo(dT)磁珠或其他方法选择性富集真核生物mRNA，并反转录合成双链cDNA，随后进行末端修复、加接头和PCR扩增，制备适用于高通量测序的文库。
链特异性转录组测序：采用链特异性建库技术进行高通量测序，能够准确区分基因的正义链和反义链转录本，获得更精确的基因表达量和结构信息。
原始测序数据质量控制：对下机原始序列进行质量评估，包括碱基质量分布、GC含量、序列重复率及接头污染检查，过滤低质量读段以获得清洁数据。
参考基因组比对：将高质量测序读段与植物或病原物的参考基因组进行比对，计算比对率和唯一比对率，评估样本来源及是否存在污染。
基因表达水平定量：基于比对结果，使用特定软件计算每个基因或转录本的表达量，通常以FPKM或TPM值表示，用于后续差异分析。
差异表达基因分析：通过统计学方法比较不同处理组（如接种病原物vs对照）间的基因表达水平，筛选出显著上调和下调的差异表达基因列表。
基因功能注释与富集分析：对差异表达基因进行GO功能注释和KEGG通路富集分析，揭示其在生物过程、分子功能和细胞组分中的角色以及参与的代谢或信号转导通路。
共表达网络分析：利用加权基因共表达网络分析方法构建基因间表达相关性网络，识别与特定性状或处理高度相关的基因模块。
可变剪切事件分析：鉴定在病原侵染条件下发生的选择性剪切事件，分析不同转录本异构体的表达变化及其潜在功能影响。
新转录本预测与注释：对于无参考基因组或注释不完善的物种，基于转录组数据组装转录本并预测新的编码区和非编码RNA区域。
qRT-PCR验证：选取部分关键的差异表达基因，利用实时荧光定量PCR技术独立验证其表达变化趋势，确认高通量测序结果的准确性。
检测范围
粮食作物与真菌互作:研究水稻、小麦、玉米等重要粮食作物在遭受稻瘟病菌、赤霉病菌等真菌侵染后的防御反应转录调控网络。
检测流程
线上咨询或者拨打咨询电话;
获取样品信息和检测项目;
支付检测费用并签署委托书;
开展实验，获取相关数据资料;
出具检测报告。
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