项目数量-463
真菌高通量测序检测
北检院检测中心 | 完成测试:次 | 2025-12-29
注意:因业务调整,暂不接受个人委托测试望见谅。
检测项目
总DNA提取与纯化:采用物理破碎与化学裂解法从复杂样本中释放真菌基因组DNA,并通过吸附柱或磁珠去除蛋白质、多糖等抑制物,确保下游扩增效率。
引物设计与特异性验证:针对真菌核糖体RNA基因内转录间隔区等保守区域设计引物,通过体外扩增测试评估其种属覆盖范围与非目标生物扩增程度。
PCR扩增与产物质检:在优化反应体系下对目标基因片段进行扩增,利用琼脂糖凝胶电泳或微流控芯片检测扩增片段大小与浓度,排除非特异性产物。
文库构建与定量:将纯化后的PCR产物连接测序接头,构建可用于高通量测序平台的DNA文库,并通过荧光定量技术精确测定文库浓度。
上机测序与质量控管:使用高通量测序平台进行双末端测序,实时监控碱基质量值与序列产量,对低质量读数进行过滤以保证原始数据可靠性。
序列预处理与去噪:通过算法剔除嵌合体序列并校正测序错误,将高质量序列按样本来源进行拆分,生成可用于分类学分析的优化序列集合。
操作分类单元聚类:基于序列相似性阈值将预处理后的序列归并为操作分类单元,减少因测序误差造成的物种数量高估。
物种分类学注释:将代表性序列与真菌专用数据库进行比对,确定各操作分类单元对应的门、纲、目、科、属、种水平分类信息。
群落多样性分析:计算香农指数、辛普森指数等α多样性指标,评估样本内真菌物种丰富度与均匀度;通过主坐标分析揭示样本间β多样性差异。
功能基因预测分析:基于已知真菌基因组数据库推测群落潜在功能特征,如碳水化合物活性酶、次级代谢产物合成基因簇的分布情况。
病原真菌筛查鉴定:比对临床或环境样本中的序列数据与病原真菌数据库,快速识别可能存在的条件致病菌或产毒真菌物种。
线上咨询或者拨打咨询电话; 获取样品信息和检测项目; 支付检测费用并签署委托书; 开展实验,获取相关数据资料; 出具检测报告。检测流程
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