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转录组差异分析
北检院检测中心 | 完成测试：次 | 2026-01-04
转录组差异分析是通过高通量测序技术，比较不同条件下生物样本基因表达水平变化的分析方法。该分析涵盖实验设计、RNA提取质检、文库构建、上机测序及生物信息学数据处理全过程。核心在于识别差异表达基因，并进行功能注释和通路富集，为生命科学研究提供关键数据支撑。
注意：因业务调整，暂不接受个人委托测试望见谅。
检测项目
总RNA提取与质量评估：采用专用试剂盒从细胞或组织中分离完整的总RNA，并通过微流控芯片分析仪评估RNA的完整性指数和纯度，确保样本质量符合后续建库要求。
mRNA富集与文库构建：利用寡核苷酸探针或核糖体RNA去除法选择性富集信使RNA片段，随后进行片段化、逆转录、末端修复及接头连接，构建可用于高通量测序的cDNA文库。
高通量测序
原始测序数据质量控制：对下机的原始测序数据进行质量评估，包括碱基质量分布、GC含量、接头污染及重复序列比例分析，筛选合格数据用于后续比对。
序列比对与基因定量：将高质量测序读段与参考基因组或转录组进行比对，统计每个基因或转录本的读段计数，计算其表达丰度如FPKM或TPM值。
差异表达基因分析：基于基因表达定量矩阵，运用统计模型如DESeq2或edgeR进行组间差异分析，筛选满足设定显著性阈值和变化倍数的差异表达基因列表。
聚类分析与可视化：对差异表达基因的表达模式进行层次聚类或主成分分析，并通过热图、火山图、散点图等图形化方式展示样本间关系及基因表达趋势。
基因本体论功能富集分析：将筛选出的差异表达基因映射到基因本体论数据库，进行生物学过程、细胞组分和分子功能层面的显著性富集分析，揭示其潜在生物学功能。
KEGG通路富集分析：基于京都基因与基因组百科全书数据库，分析差异表达基因显著富集的代谢通路或信号转导通路，阐释其在特定生理病理条件下的调控网络。
蛋白质-蛋白质互作网络构建：整合STRING等数据库信息，构建差异表达基因编码蛋白的相互作用网络，识别网络中的核心节点蛋白及其功能模块。
检测范围
疾病生物标志物筛选: 通过比较疾病组与对照组的转录组数据,识别与疾病发生发展相关的特异性高表达或低表达基因,为疾病诊断和治疗靶点开发提供候选分子.
药物作用机制研究: 分析药物处理前后细胞或动物模型转录谱变化,揭示药物对信号通路和细胞功能的调控作用,阐明其药效学及潜在副作用机制.
检测流程
线上咨询或者拨打咨询电话;
获取样品信息和检测项目;
支付检测费用并签署委托书;
开展实验，获取相关数据资料;
出具检测报告。
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