靶向整合位点分析

北检院检测中心  |  完成测试:  |  2026-01-05  

靶向整合位点分析是基因治疗与生物技术产品安全性评价的核心环节。该检测通过精确识别外源基因载体在宿主基因组中的插入位置,评估插入突变风险,为产品质量控制提供关键数据。分析过程涵盖核酸提取、文库构建、高通量测序及生物信息学分析,确保结果的准确性与可靠性。

注意:因业务调整,暂不接受个人委托测试望见谅。

检测项目

基因组DNA提取与质控:从细胞样本中分离高质量、完整性好的基因组DNA,并进行浓度、纯度及完整性检测,确保后续分析结果的可靠性。

载体序列特异性富集:利用探针杂交或PCR扩增等技术,特异性捕获含有载体-基因组连接处的DNA片段,提高目标序列的检测灵敏度。

文库构建与测序:将富集到的DNA片段进行末端修复、加接头、扩增等步骤,构建适用于高通量测序的文库,以获取足够的测序数据量。

高通量测序:采用下一代测序技术对构建的文库进行深度测序,产生海量的短序列读长,用于后续的整合位点识别。

原始测序数据质量控制:对下机原始数据进行质量评估,包括碱基质量分布、序列长度分布、接头污染及重复序列比例等指标的分析。

序列比对与定位:将高质量测序读长比对至参考基因组和载体参考序列,识别出能够跨载体与基因组边界的嵌合读长。

整合位点鉴定:基于比对结果,精确确定外源载体在宿主染色体上的插入位置坐标,并统计每个位点支持的读长数目。

整合位点聚类分析:对鉴定出的整合位点进行聚类,区分独立的插入事件与来自同一克隆的重复检测信号。

基因注释与功能影响预测:将整合位点定位至基因组的特定功能区,如基因内部、启动子区或基因沙漠区,并预测其对邻近基因功能的潜在影响。

克隆性分析:评估不同整合位点在细胞群体中的相对丰度,识别是否存在优势克隆扩增现象。

报告生成与结果解读:汇总所有分析结果,生成标准化检测报告,包括整合位点列表、基因组分布统计及风险评估结论。

检测范围

逆转录病毒载体基因治疗产品:用于治疗遗传性疾病或癌症的基于逆转录病毒的药物制品,需评估其基因组整合的安全性特征。

慢病毒载体基因治疗产品:基于慢病毒开发的体外或体内基因治疗产品,分析其在不同细胞类型中的整合偏好性。

检测流程

线上咨询或者拨打咨询电话;

获取样品信息和检测项目;

支付检测费用并签署委托书;

开展实验,获取相关数据资料;

出具检测报告。

北检(北京)检测技术研究院
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