凝胶电泳迁移率试验

北检院检测中心  |  完成测试:次  |  2026-02-28  

本检测详细介绍了凝胶电泳迁移率试验(EMSA)这一核心技术。文章系统阐述了EMSA的检测项目、应用范围、标准操作流程以及所需的关键仪器设备,旨在为分子生物学研究者提供一份全面、实用的技术指南,助力其研究蛋白质与核酸之间的特异性相互作用。

注意:因业务调整,暂不接受个人委托测试望见谅。

检测项目

蛋白质-DNA相互作用验证:验证特定转录因子或DNA结合蛋白是否能与目标DNA序列特异性结合。

蛋白质-RNA相互作用验证:研究RNA结合蛋白与特定RNA序列或结构之间的结合特性。

结合亲和力比较:通过竞争性实验,比较不同突变体蛋白或不同DNA/RNA序列与同一蛋白的结合强弱。

复合物组分鉴定:通过超迁移分析,鉴定与核酸形成复合物的蛋白质组分或复合物中是否存在多聚体。

抗体超迁移实验:使用特异性抗体识别复合物中的蛋白,产生更慢迁移的“超迁移带”,用于确认蛋白身份。

结合位点定位:通过结合竞争实验或使用突变探针,初步确定蛋白质在核酸上的关键结合位点。

动力学常数估算:在特定条件下,通过定量分析可粗略估算蛋白与核酸结合的平衡解离常数。

核提取物中结合活性检测:检测细胞核提取物中是否存在能与特定探针结合的蛋白质活性。

药物或小分子干扰评估:评估特定药物、离子或小分子化合物对蛋白质-核酸相互作用的抑制或增强效应。

突变影响分析:分析DNA/RNA序列突变或蛋白质结构域突变对两者结合能力的影响。

检测范围

转录调控研究:广泛应用于研究转录因子与其启动子、增强子等顺式作用元件的结合。

基因表达分析:用于分析特定生理或病理条件下,细胞核内DNA结合蛋白的活性变化。

病毒学:研究病毒蛋白与病毒基因组或宿主细胞基因组/RNA的相互作用。

药物开发筛选:作为体外筛选平台,寻找能干扰致病性蛋白-核酸相互作用的小分子候选药物。

信号转导通路:探究信号通路激活后,下游转录因子入核及DNA结合能力的改变。

表观遗传学:研究染色质修饰蛋白、甲基化DNA结合蛋白等与特定修饰位点的结合。

RNA生物学:用于分析RNA加工、运输、稳定性调控及翻译过程中涉及的RNA-蛋白相互作用。

微生物学:研究细菌等微生物中全局调控因子与操纵子DNA的相互作用。

植物分子生物学:研究植物抗逆、发育相关转录因子的DNA结合特性。

法医学与诊断:少数情况下用于特定蛋白标志物的检测或作为诊断工具链的一环。

检测方法

探针设计与标记:合成或PCR扩增目标DNA/RNA序列,并使用放射性同位素(如P-32)或非放射性物质(如生物素、地高辛)进行末端标记。

蛋白样品制备:制备纯化的重组蛋白、细胞核提取物或全细胞裂解液作为蛋白来源。

结合反应体系建立:将标记探针与蛋白样品在适宜缓冲液中孵育,使结合反应达到平衡。

非变性凝胶制备:配制聚丙烯酰胺或琼脂糖非变性凝胶,以保持蛋白-核酸复合物的天然状态。

电泳分离:将结合反应产物上样,在低温下进行非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳,依据分子大小和电荷分离复合物与游离探针。

竞争性实验:在反应中加入过量未标记的竞争性探针(野生型或突变型),以验证结合的特异性。

抗体超迁移实验:在结合反应中加入目标蛋白的特异性抗体,形成更大的三元复合物,导致条带进一步滞后。

凝胶干燥与固定:对于放射性标记,电泳后将凝胶干燥;对于非放射性标记,可能需要进行转膜。

信号检测:通过放射自显影、磷屏成像(放射性)或化学发光/显色检测(非放射性)可视化结果。

图像分析与定量:使用专业软件分析条带强度,对结合活性进行半定量或定量比较。

检测仪器设备

垂直电泳槽系统:用于进行非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳的核心装置,通常配备冷却循环系统以维持低温。

稳压稳流电泳仪:为电泳过程提供稳定电压和电流的电源设备。

凝胶成像系统:用于捕获和分析凝胶图像的设备,包括紫外透射仪、化学发光成像仪等。

磷屏成像系统:专门用于高灵敏度检测和定量放射性同位素标记信号的设备。

暗房与X光片夹:传统放射性自显影所需的设备,包括暗房、增感屏和X光胶片。

半干式或湿式转印仪:当使用非放射性标记并需要转膜时,用于将核酸从凝胶转移至尼龙膜上。

杂交炉或摇床:用于非放射性检测中膜的封闭、孵育抗体和洗涤步骤,确保均匀反应。

微量移液器与离心机:精确配制反应体系和处理微量样品的基本工具。

凝胶干燥机:用于将电泳后的凝胶加热真空干燥,便于放射性自显影的长期保存。

紫外分光光度计或微量核酸蛋白测定仪:用于准确测定探针、蛋白样品的浓度,确保实验定量准确。

检测流程

线上咨询或者拨打咨询电话;

获取样品信息和检测项目;

支付检测费用并签署委托书;

开展实验,获取相关数据资料;

出具检测报告。

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