质谱定量蛋白组学检测

检测项目

蛋白质表达谱分析：对生物样本中所有可检测蛋白质进行系统性鉴定和相对或绝对定量，描绘整体蛋白质表达水平。

差异表达蛋白筛选：比较不同生理或病理状态下样本的蛋白质表达量，识别显著上调或下调的关键蛋白。

翻译后修饰分析：鉴定并定量蛋白质的磷酸化、乙酰化、泛素化、糖基化等修饰位点及修饰程度的变化。

蛋白质相互作用研究：通过亲和纯化结合质谱分析，鉴定与目标蛋白相互作用的蛋白复合物成员。

生物标志物发现与验证：从复杂样本中筛选并验证具有疾病诊断、预后或疗效预测潜能的候选蛋白质标志物。

信号通路与网络解析：基于定量数据，构建和解析蛋白质参与的细胞信号转导通路及调控网络。

绝对定量分析：使用同位素标记的重肽标准品，对特定目标蛋白进行精确定量，获得拷贝数或摩尔浓度。

亚细胞器蛋白质组分析：分离特定细胞器（如线粒体、细胞核），研究其蛋白质组成及动态变化。

蛋白质周转率测定：通过稳定同位素标记技术，测量蛋白质的合成与降解速率，研究其动态平衡。

临床样本大队列分析：对大量临床样本（如血清、组织）进行高通量、可重复的蛋白组学分析，用于转化医学研究。

检测范围

人体组织与体液：包括肿瘤组织、正常组织、血清、血浆、脑脊液、尿液、唾液等多种临床样本。

细胞与细胞系：涵盖原代细胞、培养的细胞系、干细胞以及经过不同处理的细胞模型。

模式生物样本：适用于小鼠、大鼠、斑马鱼、果蝇、酵母、植物等多种模式生物的整体或器官样本。

微生物与病原体：用于细菌、真菌、病毒等微生物的蛋白质组成分析及宿主-病原体相互作用研究。

外泌体与微囊泡：分离并分析细胞分泌的外泌体等胞外囊泡中的蛋白质内容物，用于细胞通讯研究。

FFPE存档样本：对福尔马林固定石蜡包埋的组织样本进行蛋白质提取和组学分析，回溯性研究珍贵临床资源。

单细胞或微量样本：利用超高灵敏度质谱技术，实现对单个或少数细胞的蛋白质组进行深度分析。

食品与农产品：应用于食品成分分析、过敏原检测、转基因产品鉴定及农产品品质研究。

药物与毒理学研究：评估药物处理或毒物暴露后，生物体内蛋白质组的动态响应和分子机制。

环境与生态样本：分析特定环境微生物群落或生物在环境压力下的蛋白质组响应。

检测方法

标记定量方法（TMT/iTRAQ）：使用同位素编码的化学标签对不同样本的肽段进行标记，混合后同时上机，实现多通道相对定量。

非标记定量方法（Label-free）：基于质谱信号强度或谱图计数，直接比较不同样本中肽段/蛋白的信号，无需化学标记。

目标蛋白定量方法（PRM/SRM）：针对预设的目标蛋白/肽段，在质谱上进行选择性离子监测，实现高灵敏度、高重复性的绝对定量。

数据依赖性采集（DDA）：全扫描后自动选择强度最高的前体离子进行碎裂，适用于未知蛋白组的发现性分析。

数据非依赖性采集（DIA/SWATH）：将质谱全扫描范围划分为多个窗口，依次碎裂窗口内所有离子，获得近乎完整的数字化蛋白组图谱。

稳定同位素标记氨基酸细胞培养（SILAC）：在细胞培养基中加入重标氨基酸，使新合成蛋白带上质量标签，用于细胞模型的精准定量。

免疫共沉淀-质谱联用（Co-IP/MS）：利用抗体捕获目标蛋白及其互作蛋白，再通过质谱鉴定互作网络成员。

磷酸化肽段富集技术：采用TiO2、IMAC或抗体等方法特异性富集磷酸化修饰肽段，大幅提高修饰位点鉴定深度。

液相色谱分离技术：利用反相色谱、强阳离子交换色谱等进行多维分离，降低样本复杂度，提升鉴定数量。

生物信息学分析流程：包括数据库搜索、定量计算、统计学检验、功能富集分析和可视化等一系列数据处理与解读方法。

检测仪器设备

高分辨串联质谱仪（Q-TOF系列）：如Sciex TripleTOF、Bruker timsTOF等，具有高分辨率、高质量精度和高扫描速度，是DIA技术的核心设备。

轨道阱系列质谱仪（Orbitrap）：如Thermo Fisher的QE系列、Exploris系列，以其超高分辨率和质量精度著称，是蛋白组学的主流平台。

三重四极杆质谱仪（QQQ）：如Agilent 6495系列，具有极高的灵敏度和稳定性，是进行靶向定量（SRM/PRM）的金标准仪器。

纳升液相色谱系统（nano-LC）：用于将复杂肽段混合物在线分离并直接导入质谱离子源，是深度蛋白组学的关键前端分离设备。

高效液相色谱系统（HPLC/UHPLC）：用于样本预处理、肽段分级或与质谱联用进行常规流速下的分离分析。

超声波细胞破碎仪：用于高效裂解细胞和组织，释放细胞内总蛋白质，是蛋白质提取的重要工具。

高速/超速离心机：用于样本预处理过程中的细胞收集、细胞器分离、沉淀去除等关键步骤。

酶解与样品处理工作站：自动化或半自动化设备，用于实现蛋白质还原烷基化、酶解、除盐等流程的标准化和高通量化。

蛋白质定量分析仪（如NanoDrop, BCA分析仪）：用于精确测定蛋白质提取液或肽段溶液的浓度，确保上样量的一致性。

高性能计算服务器与存储阵列：用于存储海量的原始质谱数据，并运行计算密集型的数据库搜索和生物信息学分析软件。

检测流程

线上咨询或者拨打咨询电话;

获取样品信息和检测项目;

支付检测费用并签署委托书;

开展实验，获取相关数据资料;

出具检测报告。