蛋白质组学定量分析

检测项目

差异表达蛋白分析：通过比较不同生理或病理状态下样本中蛋白质的表达丰度，识别显著上调或下调的蛋白质，是功能研究的基础。

蛋白质绝对定量：使用已知浓度的同位素标记标准肽段，精确测定目标蛋白质在样本中的绝对摩尔浓度或拷贝数。

蛋白质相对定量：在不同样本间比较同一蛋白质的丰度变化，通常以比率形式表示，用于差异表达分析。

翻译后修饰定量分析：对蛋白质的磷酸化、乙酰化、泛素化等修饰位点进行定性和定量，揭示蛋白质功能的动态调控。

蛋白质相互作用组定量：在定量层面研究蛋白质-蛋白质相互作用网络，比较不同条件下相互作用强度的变化。

蛋白质组动力学分析：通过稳定同位素标记技术，测定蛋白质的合成速率与降解速率，研究蛋白质周转代谢。

亚细胞器蛋白质组定量：对细胞器（如线粒体、细胞核）内的蛋白质组成进行分离和定量，研究其特定功能与组成变化。

蛋白质复合物组分定量：对特定蛋白质复合物的各个组分进行精确定量，分析其组装比例和稳定性。

蛋白质异构体与变异体定量：区分并定量由同一基因产生的不同剪接异构体或遗传变异体，探究其功能异质性。

生物标志物发现与验证：通过大规模定量筛选，寻找与疾病诊断、预后或治疗反应相关的潜在蛋白质标志物，并进行靶向验证。

检测范围

全组织/器官裂解液：对完整的动物或植物组织进行均质化处理后的总蛋白提取物，反映组织整体的蛋白质表达谱。

血清/血浆样本：对血液中的无细胞液体成分进行分析，是发现循环生物标志物的主要样本类型。

细胞系全蛋白提取物：来源于培养的贴壁或悬浮细胞，是机制研究和药物筛选中最常用的标准化样本。

外泌体等细胞外囊泡：对细胞分泌的纳米级囊泡内的蛋白质进行定量，研究细胞间通讯和疾病诊断。

福尔马林固定石蜡包埋组织：对临床存档的FFPE样本进行蛋白质组分析，实现回顾性临床研究。

激光显微切割样本：从组织切片中精确切割特定形态区域（如肿瘤灶），实现空间分辨的微量蛋白质组分析。

免疫共沉淀产物：对通过抗体富集的目标蛋白及其互作蛋白复合物进行定量，研究特异性相互作用。

亚细胞组分：通过差速离心、密度梯度离心等方法分离得到的细胞器或膜组分，进行定位特异性分析。

单细胞水平蛋白质组：利用超高灵敏度技术对单个细胞内的蛋白质进行定量，揭示细胞异质性。

植物或微生物全蛋白提取物：涵盖模式植物、农作物以及细菌、真菌等微生物的蛋白质组定量分析。

检测方法

非标记定量技术：基于质谱采集的肽段离子信号强度或谱图计数进行相对定量，无需预先进行化学标记，流程简单。

TMT/iTRAQ标记定量：使用胺反应性同位素标签对多组样本肽段进行多重标记，在一次质谱运行中同时比较多达16组样本。

SILAC标记定量：在细胞培养过程中使用稳定同位素标记的必需氨基酸，使蛋白质在体内被标记，实现高效的代谢标记定量。

靶向蛋白质组学：利用选择/平行反应监测技术，对预设的一组目标蛋白质/肽段进行高灵敏度、高重复性的绝对或相对定量。

数据非依赖采集技术：以固定隔离窗口循环采集所有肽段碎片信息，克服数据依赖采集的随机性，提高定量的重现性和覆盖度。

二甲基标记定量：使用低成本、高效的甲醛和氰基硼氢化钠对肽段N端和赖氨酸侧链进行轻/重同位素标记。

磷酸化等修饰组富集策略：结合TiO2、IMAC等金属亲和层析技术特异性富集修饰肽段，再进行质谱定量分析。

SWATH-MS采集技术：一种特定的DIA方法，将质谱全扫描范围划分为连续的小窗口进行碎片扫描，结合谱图库进行定量解析。

基于抗体芯片的定量：利用固定在芯片上的抗体捕获目标蛋白，通过荧光或化学发光信号进行高通量相对定量。

自上而下蛋白质组学：对完整蛋白质直接进行质谱分析和定量，保留完整的翻译后修饰信息和蛋白异构体信息。

检测仪器设备

高分辨率串联质谱仪：如Orbitrap系列和Q-TOF系列，提供高分辨率、高质量精度和快速扫描速度，是发现组学的核心设备。

三重四极杆质谱仪：具备出色的灵敏度和特异性，是进行靶向蛋白质绝对定量和PRM/SRM分析的金标准仪器。

纳升液相色谱系统：使用微径色谱柱和极低流速，极大提高电喷雾离子化效率和质谱检测灵敏度，用于复杂肽段分离。

高效液相色谱系统：用于样本预分离、肽段分级或高上样量的常规分离，常与质谱联用构成LC-MS/MS系统。

超声波细胞破碎仪：利用超声波空化效应高效裂解细胞和组织，释放细胞内总蛋白质，同时避免过度产热。

高速低温离心机：用于样本制备过程中的细胞收集、细胞器分离、蛋白沉淀等关键步骤，保持蛋白质活性与完整性。

蛋白质定量分析仪：如基于BCA、Lowry法的微孔板读数仪，用于精确测定蛋白样品浓度，确保上样量一致性。

SDS-PAGE电泳系统：用于蛋白质复杂性评估、样本质量控制和预分离，常与Western Blotting或胶内酶切联用。

自动化样品处理工作站：实现从蛋白提取、酶切、除盐到上样等一系列步骤的自动化，提高通量和重复性，减少人为误差。

高性能计算集群与存储系统：用于处理海量的原始质谱数据，运行数据库搜索和定量算法，是生物信息学分析的基础设施。

检测流程

线上咨询或者拨打咨询电话;

获取样品信息和检测项目;

支付检测费用并签署委托书;

开展实验，获取相关数据资料;

出具检测报告。