核酸残留测试

北检院检测中心  |  完成测试:  |  2026-03-25  

本检测详细阐述了核酸残留测试的关键技术环节,涵盖核心检测项目、广泛的应用范围、主流及前沿的检测方法,以及必需的仪器设备。文章旨在为生物制药、基因治疗及疫苗生产等相关领域的质量控制与安全评估提供系统的技术参考。

注意:因业务调整,暂不接受个人委托测试望见谅。

检测项目

宿主细胞DNA残留:检测生物制品中来源于生产所用工程细胞(如CHO、HEK293)的残留DNA,评估其潜在致瘤风险。

质粒DNA残留:在病毒载体或mRNA疫苗生产中,检测用于转染的模板质粒DNA的清除情况。

载体骨架序列残留:针对基因治疗产品,特异性检测病毒载体中非目标基因的骨架DNA序列。

核糖体RNA残留:在基于RNA的产品或生产过程中,检测具有高丰度特性的rRNA残留。

线粒体DNA残留:检测来源于宿主细胞线粒体的特异性DNA,作为工艺清除效果的补充指标。

特异性序列残留:针对生产过程中使用的特定基因元件(如抗性基因、启动子)进行靶向检测。

总核酸残留:非特异性定量样品中所有DNA和RNA的总量,用于工艺过程的快速监控。

单链与双链核酸区分:鉴别残留核酸的物理状态,这对评估其生物学活性至关重要。

核酸片段大小分布:分析残留核酸的片段长度,大片段DNA通常被认为风险更高。

外源性DNA残留:检测可能来自原料、环境或交叉污染的非预期物种DNA。

检测范围

重组蛋白药物:如单克隆抗体、细胞因子等,需严格控制宿主细胞DNA残留。

病毒载体疫苗:包括腺病毒、慢病毒、腺相关病毒载体疫苗,需检测载体骨架及生产细胞DNA残留。

mRNA疫苗与疗法:需检测模板质粒DNA残留,以及体外转录工艺中可能产生的异常RNA。

细胞与基因治疗产品:如CAR-T细胞、干细胞疗法,对终产品及中间品进行多重核酸残留监控。

血液制品:检测可能存在的供者白细胞残留DNA,确保产品安全性。

疫苗生产用细胞基质:对用于病毒培养的细胞(如Vero、MDCK细胞)DNA残留进行放行检测。

生物工艺原材料:如培养基、血清、酶制剂等,评估其引入的外源核酸风险。

纯化工艺验证:在纯化步骤的中间样品JianCe测核酸,评估下游工艺的清除能力。

医疗器械提取液:对与人体接触的医疗器械(如植入物)的浸提液进行核酸残留测试。

细胞培养上清:在生物反应器培养过程中,监控细胞裂解释放到上清中的核酸含量。

检测方法

实时荧光定量PCR:高灵敏度、高特异性的绝对定量金标准方法,可检测至fg/剂量水平。

数字PCR:无需标准曲线的绝对定量方法,尤其适用于复杂基质中痕量核酸的检测,精度更高。

杂交法:如斑点杂交或Southern blot,利用标记探针进行半定量或定性检测,特异性好。

阈值法:一种均相杂交免疫化学方法,可快速检测双链DNA的总量,常用于工艺过程监控。

荧光染料法:使用PicoGreen等染料非特异性结合双链DNA,快速定量总DNA,但无法区分来源。

毛细管凝胶电泳:高分辨率分析核酸片段大小分布,评估残留DNA的片段化程度。

下一代测序:用于未知核酸序列的鉴定、宿主细胞基因组残留的全面分析及深度表征。

酶联免疫吸附法:通过抗DNA抗体捕获和检测,适用于部分产品的DNA残留测定。

羟基磷灰石色谱法:基于核酸与羟基磷灰石特异性结合的经典分离检测方法。

基于CRISPR的检测:新兴的高特异性检测技术,利用Cas酶的报告系统实现对特定序列的超灵敏检测。

检测仪器设备

实时荧光定量PCR仪:进行qPCR检测的核心设备,具备多通道荧光检测与温控功能。

数字PCR系统:实现微滴生成与分析的平台,用于绝对定量分析,如微滴式或芯片式dPCR仪。

核酸提取纯化仪:自动化完成样品裂解、核酸结合、洗涤与洗脱,确保检测前处理的一致性与效率。

微量分光光度计/荧光计:用于快速测定核酸浓度与纯度,如NanoDrop或配备PicoGreen检测模块的仪器。

毛细管电泳系统:如Fragment Analyzer或Bioanalyzer,用于核酸片段大小分析与定量。

下一代测序仪:用于深度核酸残留表征的测序平台,如Illumina、Ion Torrent等品牌机型。

酶标仪:用于读取ELISA、阈值法或荧光染料法的吸光度或荧光信号。

杂交炉与成像系统:用于杂交法检测,提供恒温杂交环境并对杂交膜进行化学发光或荧光成像。

超微量核酸蛋白检测仪:基于紫外吸收原理,适用于极微量样品的核酸浓度检测。

生物安全柜:为核酸样品前处理提供无菌无污染的操作环境,防止交叉污染及保护操作者。

检测流程

线上咨询或者拨打咨询电话;

获取样品信息和检测项目;

支付检测费用并签署委托书;

开展实验,获取相关数据资料;

出具检测报告。

北检(北京)检测技术研究院
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