核酸修饰检测

检测项目

DNA甲基化（5-mC）检测：检测DNA链上胞嘧啶第5位碳原子的甲基化修饰，是表观遗传学研究的基础项目。

DNA羟甲基化（5-hmC）检测：检测5-羟甲基胞嘧啶，这是DNA去甲基化过程中的关键中间修饰。

DNA甲酰基化（5-fC）与羧基化（5-caC）检测：检测DNA主动去甲基化途径中产生的两种氧化衍生物。

N6-甲基腺嘌呤（6mA）检测：检测DNA中腺嘌呤N6位的甲基化修饰，在原核生物和真核生物中均有重要功能。

RNA m6A修饰检测：检测信使RNA（mRNA）上最常见的N6-甲基腺苷修饰，参与转录后调控。

RNA假尿嘧啶（Ψ）检测：检测RNA中尿嘧啶的异构化修饰，影响RNA结构和功能。

RNA 5-甲基胞嘧啶（m5C）检测：检测RNA中胞嘧啶第5位碳原子的甲基化修饰。

RNA 2‘-O-甲基化修饰检测：检测核糖2‘-氧位的甲基化，常见于核糖体RNA和转移RNA。

N1-甲基腺嘌呤（m1A）检测：检测RNA中腺嘌呤N1位的甲基化，影响翻译效率。

N7-甲基鸟苷（m7G）检测：检测RNA 5‘端帽结构或内部位置的甲基化，对mRNA稳定性和翻译至关重要。

检测范围

全基因组范围甲基化分析：对基因组所有CpG岛或非CpG区域的甲基化状态进行无偏性扫描。

特定基因座靶向检测：针对启动子、增强子等特定功能区域的核酸修饰进行精准分析。

不同物种样本：涵盖人类、动物、植物、微生物等多种生物体的基因组和转录组修饰。

多种细胞与组织类型：包括血液、组织切片、培养细胞、干细胞、肿瘤细胞等不同来源的样本。

循环游离DNA（cfDNA）：检测血液等体液中游离DNA的修饰状态，用于无创产前诊断和肿瘤早筛。

单细胞水平修饰分析：在单个细胞分辨率下研究核酸修饰，揭示细胞异质性。

不同RNA类型：涵盖mRNA、lncRNA、miRNA、rRNA、tRNA等多种RNA分子的修饰检测。

古DNA修饰检测：对考古样本中的古代DNA进行修饰分析，用于进化与考古研究。

微生物组甲基化图谱：分析复杂微生物群落中细菌基因组的修饰模式，用于微生物组研究。

外泌体核酸修饰：检测细胞外囊泡（如外泌体）中所携带的核酸分子的修饰状态。

检测方法

亚硫酸氢盐测序（BS-seq）：通过亚硫酸氢盐处理将未甲基化的胞嘧啶转化为尿嘧啶，结合测序进行DNA甲基化检测的金标准方法。

氧化亚硫酸氢盐测序（oxBS-seq）：在BS-seq基础上，通过氧化步骤区分5-mC和5-hmC，实现高分辨率检测。

TET辅助吡啶硼烷测序（TAB-seq）：利用TET酶和吡啶硼烷化学，特异性检测5-hmC的高精度方法。

MeDIP-seq（甲基化DNA免疫共沉淀测序）：使用抗5-mC抗体富集甲基化DNA片段，再进行高通量测序。

m6A-seq（MeRIP-seq）：利用抗m6A抗体对含有m6A修饰的RNA片段进行免疫沉淀和测序。

液相色谱-质谱联用（LC-MS/MS）：通过色谱分离和质谱定量，对酶解后的修饰核苷进行绝对定量分析。

SCARLET（位点特异性切割和放射性标记延伸检测）：一种用于精确鉴定单个位点RNA修饰的生化方法。

基于第三代测序的直接检测：利用牛津纳米孔或PacBio SMRT测序技术，通过原始信号直接识别核酸修饰。

化学标记与点击化学法：通过特异性化学标记（如炔基标记）结合点击化学反应，实现修饰的富集与检测。

酶学检测法：利用对修饰敏感或特异的限制性内切酶、连接酶等，通过酶切效率差异来检测修饰状态。

检测仪器设备

高通量测序仪：如Illumina NovaSeq、HiSeq系列，用于进行全基因组甲基化测序（WGBS）和修饰RNA测序。

第三代测序仪：如Oxford Nanopore PromethION、PacBio Sequel IIe，可实现长读长和直接修饰检测。

液相色谱-串联质谱仪（LC-MS/MS）：如Agilent、Thermo Fisher的Triple Quadrupole系统，用于修饰核苷的精准定量。

高性能液相色谱仪（HPLC）：用于分离和初步分析核酸酶解产物中的修饰成分。

实时荧光定量PCR仪：用于对经过亚硫酸氢盐处理的特定基因位点进行甲基化水平的定量分析。

数字PCR系统：提供绝对定量，用于超灵敏检测低频修饰或稀有样本中的修饰变化。

超声破碎仪：用于将基因组DNA或染色质片段化至适合建库的大小。

磁珠分离系统：用于核酸的纯化、片段筛选以及免疫共沉淀后的洗涤与洗脱步骤。

生物分析仪/片段分析仪：如Agilent Bioanalyzer，用于评估核酸样本的质量、浓度和片段分布。

超微量核酸蛋白测定仪：用于精确测量低体积、低浓度核酸样本的浓度，确保后续实验的准确性。

检测流程

线上咨询或者拨打咨询电话;

获取样品信息和检测项目;

支付检测费用并签署委托书;

开展实验，获取相关数据资料;

出具检测报告。