宏基因组食源菌群检测

检测项目

微生物群落结构分析：评估细菌、真菌等分类单元相对丰度。检测参数包含操作分类单元数量、香农多样性指数、辛普森均匀度指数。

食源性病原体筛查：识别沙门氏菌属、李斯特菌属等致病微生物。检测参数包括特异基因标记检出限、病原体相对丰度阈值。

抗生素抗性基因检测：分析β-内酰胺酶类、四环素抗性基因分布。检测参数涵盖抗性基因拷贝数、基因型多样性指数。

微生物功能预测：基于KEGG通路注释代谢功能。检测参数包含通路丰度值、酶编码基因覆盖率。

真菌毒素合成基因检测：定位黄曲霉毒素、赭曲霉毒素合成相关基因簇。检测参数涉及合成酶基因完整性评分、表达水平评估。

病毒组分析：检测诺如病毒、甲肝病毒等食源性病毒序列。检测参数包括病毒基因组覆盖度、reads比对率。

质粒携带评估：识别可移动遗传元件分布特征。检测参数含接合转移基因检出率、质粒复制子类型数量。

腐败微生物定量：测定假单胞菌属、乳酸菌属等腐败相关菌群。检测参数涵盖特定扩增子序列变异体丰度。

益生菌特征分析：评估双歧杆菌属、乳杆菌属等功能菌株。检测参数包括菌株特异性标记基因匹配度。

环境抗性基因检测：分析生物膜形成相关基因表达。检测参数涉及胞外多糖合成酶基因检出阈值。

古菌群落鉴定：检测产甲烷古菌等特殊微生物类群。检测参数包含古菌特征基因片段覆盖率。

微生物互作网络：构建菌群共现关系模型。检测参数含Spearman相关系数显著性水平。

检测范围

乳制品原料：生鲜乳、发酵乳制品中活性微生物群落组成。

肉禽制品：冷鲜肉、预制肉制品表面与内部菌群分布。

水产加工品：鱼糜制品、即食海产品微生物污染溯源。

果蔬制品：鲜切蔬菜、水果酱料腐败微生物生态分析。

谷物制品：面粉、烘焙食品真菌群落动态监测。

发酵食品：酱油、豆豉等传统发酵过程菌群演替。

食品接触材料：包装材料表面生物膜形成评估。

食品加工环境：生产设备表面残留微生物群落特征。

饮用水源：瓶装水、直饮水系统微生物安全评价。

特殊膳食：婴幼儿配方食品病原体污染风险筛查。

调味品基质：酱料、复合调味料微生物多样性图谱。

冷链运输品：冷藏物流环节微生物交叉污染追踪。

检测标准

ISO 16140-6:2019微生物检测方法验证规范

ISO 20395:2018高通量测序技术要求

GB 4789.35-2023食品微生物学检验乳酸菌检验

GB/T 38573-2020高通量测序数据分析指南

ISO 21528-2:2017肠杆菌科检测方法

GB 4789.30-2023单核细胞增生李斯特氏菌检验

ISO 22117:2019食品链微生物定量检测要求

GB/T 40982-2021微生物宏基因组测序技术通则

ISO 20836:2021分子生物学检测环境控制

GB 4789.4-2023沙门氏菌检验标准

检测仪器

高通量测序平台：完成DNA片段双端测序。功能参数包含读长150-300bp、通量≥50Gb/run。

核酸定量系统：测定DNA浓度与完整性。功能参数含检测灵敏度0.1ng/μl、DV200值分析。

自动化提取工作站：实现样本并行处理。功能参数包含96孔板同步处理能力、提取效率≥85%。

生物分析系统：评估文库片段分布。功能参数涵盖DNA片段大小检测范围35-15000bp。

超低温存储设备：维持核酸样本稳定性。功能参数含-80℃恒温控制、温度波动±2℃。

高速离心机：分离微生物细胞组分。功能参数涉及最大离心力≥30000×g、温控精度±1℃。

梯度PCR仪：完成靶向扩增程序。功能参数包含温控速率≥5℃/s、模块温度均一性±0.5℃。

超纯水制备系统：提供分子级实验用水。功能参数涵盖电阻率18.2MΩ·cm、总有机碳≤5ppb。

检测流程

线上咨询或者拨打咨询电话;

获取样品信息和检测项目;

支付检测费用并签署委托书;

开展实验，获取相关数据资料;

出具检测报告。