细胞转录组测序检测

检测项目

RNA完整性检测：评估RNA样本降解程度。具体检测参数：RIN值（RNA完整性数值），范围1-10，最低要求≥7。

文库浓度测定：测量测序文库的DNA浓度。具体检测参数：浓度单位ng/μl，精度±5%，检测范围0.1-100ng/μl。

片段大小分布分析：确定文库片段长度范围。具体检测参数：平均片段大小bp，偏差范围±50bp，目标大小150-500bp。

测序深度评估：量化每个样本的序列覆盖度。具体检测参数：平均深度×，目标区域覆盖百分比≥90%，最小深度10×。

比对率计算：衡量序列与参考基因组的匹配效率。具体检测参数：比对百分比≥70%，误比对率<0.1%。

基因表达定量：计算基因表达水平。具体检测参数：FPKM值或TPM值，线性范围1-10000，变异系数<5%。

差异表达分析：识别不同条件下的基因表达变化。具体检测参数：log2 fold change绝对值≥2，p值<0.05，错误发现率<0.1。

可变剪切检测：分析基因的可变剪切事件。具体检测参数：剪切事件百分比，支持读取数≥10，精确度95%。

融合基因识别：检测可能的基因融合事件。具体检测参数：融合断点支持读取数≥5，置信度≥90%。

质量控制指标综合评估：整体质量度量。具体检测参数：Q30分数≥85%，错误率<0.1%，GC含量偏差±5%。

污染检测：筛查外来核酸污染。具体检测参数：外源RNA百分比<0.5%，检测限0.1%。

基因富集分析：识别功能富集的基因集。具体检测参数：富集分数，p值<0.01，倍数变化≥2。

检测范围

细胞培养样本：哺乳动物或昆虫细胞系的RNA分析。

组织样本：冷冻或福尔马林固定石蜡包埋的生物组织RNA。

血液样本：全血或分离细胞成分的转录组研究。

单细胞样本：单个细胞的基因表达谱分析。

微生物样本：细菌或真菌RNA的群落多样性检测。

植物样本：植物组织RNA的生长调控研究。

发育生物学研究：胚胎发育阶段的转录动态分析。

疾病模型应用：癌症或神经退行性疾病细胞模型的表达变化。

药物筛选：化合物处理后的基因表达响应评估。

环境样本：土壤或水体中微生物群落的转录活性检测。

干细胞研究：多能干细胞分化过程的表达谱变化。

免疫细胞分析：免疫应答中的基因表达模式辨识。

检测标准

ISO 20387:2018生物技术—生物样本库—通用要求。

GB/T 34056-2017高通量测序数据质量控制规范。

EN ISO 15189:2012医学实验室—质量和能力准则。

ASTM E3136-18测序数据质量控制标准指南。

ISO/IEC 17025:2017检测和校准实验室能力要求。

GB/T 37869-2019RNA测序文库构建技术规范。

ISO 20395:2018测序质量标准—数据准确性。

GB/T 27407-2010实验室质量控制规范通用要求。

EN ISO 10993-18:2020生物材料测试—分子方法。

ISO 5725-2:2019测量方法与结果准确度评估。

检测仪器

高通量测序仪：执行大规模平行测序生成序列数据。在本检测中用于RNA样本的DNA测序和数据产出。

生物分析仪：评估核酸样本质量和片段分布。在本检测中测量RNA完整性RIN值和文库大小。

实时定量PCR系统：验证基因表达水平。在本检测中确认差异表达基因的定量结果。

分光光度计：测定核酸浓度和纯度。在本检测中分析RNA样本的A260/A280比值和浓度。

离心机：分离样本组分和沉淀提取物。在本检测中用于RNA提取过程中的离心分离。

微流体平台：捕获和处理单细胞样本。在本检测中构建单细胞测序文库。

冷存储设备：保存RNA样本防止降解。在本检测中维持样本在-80°C条件下以确保完整性。

检测流程

线上咨询或者拨打咨询电话;

获取样品信息和检测项目;

支付检测费用并签署委托书;

开展实验，获取相关数据资料;

出具检测报告。