代谢通路富集检测

检测项目

通路显著性分析：计算预设通路中差异基因的富集程度。采用超几何检验或Fisher精确检验，设定P值阈值≤0.05。

基因集富集分析：检测基因排序列表中的通路富集趋势。执行1000次置换检验，富集分数FDR≤0.25。

拓扑特征整合：评估通路节点连接度对富集结果的影响。应用基于网络中心性的加权分析方法。

多重假设校正：控制整体错误发现率。采用Benjamini-Hochberg方法校正P值。

通路层级结构分析：解析上级通路与子通路关联性。基于GO/KEGG树状结构进行层级富集。

交叉物种通路比对：识别进化保守功能模块。执行同源基因映射与通路活性一致性检验。

时间序列富集：检测动态生物过程中的通路激活时序。应用多项式回归模型分析表达轨迹。

组织特异性富集：量化通路在不同器官系统的活性差异。基于GTEx数据库进行特异性指数计算。

互作网络模块化：识别共表达基因簇关联通路。采用Walktrap算法实现模块检测。

代谢流富集建模：整合代谢物浓度与通量数据。应用通量平衡分析验证通路活性。

检测范围

肿瘤组织样本：癌变组织与癌旁组织的对比性通路分析。

单细胞转录组数据：细胞亚群特异性通路活动特征挖掘。

微生物宏基因组：环境微生物群落的代谢功能潜力评估。

药物处理细胞系：药物作用机制相关的信号通路扰动检测。

转基因生物模型：基因修饰引发的系统性通路功能改变。

临床血清代谢组：疾病生物标志物相关的代谢通路筛查。

植物胁迫响应：非生物胁迫下植物生理通路调节模式。

工程菌株改造：合成生物学中代谢途径优化效果验证。

古DNA样本：灭绝物种代谢特征重建。

污染物暴露模型：环境毒理学中的细胞应激通路激活评估。

检测标准

ISO/IEC17025:2017检测和校准实验室能力通用要求

GB/T37864-2019生物样本库质量和能力通用要求

ENISO20914:2019医学实验室测量不确定度评定要求

GB/T27407-2010实验室质量控制规范分子生物学检测

ISO20395:2018生物技术核酸靶序列检测方法验证要求

GB/T34796-2017核酸数据库数据元素规范

ISO23118:2021蛋白质组学数据报告标准

GB/T38502-2020检测方法验证规范

检测仪器

高通量核酸测序仪：完成全转录组测序，获取基因表达矩阵。测序深度≥30Mreads/sample。

液相色谱质谱联用系统：定量代谢物浓度，解析代谢通路活性。质量精度≤2ppm。

高性能计算集群：执行大规模富集算法运算。配置≥512核CPU及并行存储架构。

生物信息分析平台：集成通路数据库与统计工具包。支持GO/KEGG/Reactome等15类注释源。

自动化核酸提取工作站：保障样本处理标准化。通量≥96样本/批次，CV值≤5%。

荧光定量PCR仪：验证关键通路基因表达。动态范围10⁷，灵敏度≤5拷贝/反应。

检测流程

线上咨询或者拨打咨询电话;

获取样品信息和检测项目;

支付检测费用并签署委托书;

开展实验，获取相关数据资料;

出具检测报告。