小鼠基因表达丰度测定检测

北检院检测中心  |  完成测试:  |  2025-09-26  

小鼠基因表达丰度测定检测是分子生物学研究中的关键环节,旨在定量分析特定基因在小鼠样本中的mRNA表达水平。检测过程注重RNA样本质量评估、逆转录效率控制、扩增反应特异性验证以及数据标准化处理,确保表达量数据的准确性和可重复性,为功能基因组学研究提供可靠依据。

注意:因业务调整,暂不接受个人委托测试望见谅。

检测项目

RNA提取纯度检测:通过紫外分光光度法测定RNA样本在260纳米和280纳米处的吸光度比值,评估样本中蛋白质或有机物污染程度,确保RNA纯度满足后续逆转录和扩增反应要求,避免杂质干扰定量结果。

RNA完整性评估:采用电泳或微流控技术分析RNA条带完整性,检查28S和18S核糖体RNA条带清晰度与比值,确认RNA无降解现象,保证基因表达丰度测定中模板质量可靠。

cDNA合成效率检测:通过对比逆转录反应前后RNA与cDNA的定量值,评估逆转录酶将mRNA转化为cDNA的转化率,确保cDNA模板量准确,为后续实时荧光定量PCR提供标准化基础。

实时荧光定量PCR分析:利用荧光染料或探针监测PCR扩增过程中荧光信号积累,动态测定基因扩增曲线,通过Ct值计算初始模板量,实现基因表达水平的绝对或相对定量。

数字PCR检测:将样本分割为数千个微反应单元进行独立PCR扩增,通过阳性反应单元计数直接计算目标基因拷贝数,无需标准曲线即可实现绝对定量,提高检测精准度。

微阵列基因表达分析:将标记的cDNA与固定于芯片上的探针杂交,通过扫描杂交信号强度同时检测数千个基因表达水平,适用于高通量筛选差异表达基因。

RNA测序丰度测定:通过高通量测序技术获取转录本序列信息,计算 reads 比对到基因区域的计数,基于标准化算法如TPM或FPKM定量基因表达丰度,提供全转录组覆盖。

内参基因稳定性验证:评估候选内参基因在不同实验条件下的表达稳定性,通过geNorm或BestKeeper算法选择变异系数最小的基因作为标准化参照,减少样本间误差。

引物特异性检测:通过熔解曲线分析或凝胶电泳验证引物扩增产物的单一性,确保无非特异性扩增或引物二聚体形成,保证qPCR结果特异性与准确性。

扩增曲线分析:监测PCR扩增过程中荧光信号随循环数的变化曲线,评估扩增效率、平台期和基线设置,识别异常扩增反应,优化定量循环阈值确定。

熔解曲线分析:在PCR结束后逐步升温并监测荧光信号变化,通过熔解峰形判断扩增产物的特异性与纯度,区分目标产物与非特异性产物,验证反应特异性。

标准曲线制备:使用系列稀释的标准品进行qPCR扩增,以Ct值对模板浓度对数作图生成标准曲线,用于未知样本的绝对定量或扩增效率校正。

检测范围

小鼠肝脏组织样本:来源于小鼠肝脏的RNA样本,常用于代谢相关基因表达研究,需确保组织取材快速、RNA保存完整以避免降解影响丰度测定准确性。

小鼠脑组织样本:包括皮层、海马等特定脑区组织,用于神经科学基因表达分析,样本异质性高,需精细解剖与均质化处理以保证代表性。

小鼠胚胎干细胞:多能性干细胞样本,应用于发育生物学研究,检测时需注意细胞状态一致性,避免分化影响基因表达背景值。

小鼠肿瘤模型组织:源自移植瘤或基因工程肿瘤模型的样本,用于癌基因或抑癌基因表达评估,需考虑肿瘤异质性与坏死区域对RNA质量的影响。

小鼠血液样本:全血或分离的血细胞样本,适用于免疫或循环生物标志物研究,需快速处理防止RNA酶降解,并去除基因组DNA干扰。

小鼠肌肉组织:骨骼肌或心肌组织样本,用于运动生理或疾病模型研究,组织纤维丰富,需优化裂解条件确保RNA提取效率。

小鼠肠道微生物组相关样本:肠道组织或内容物样本,研究宿主-微生物互作基因表达,需区分宿主与微生物RNA,避免交叉污染。

小鼠神经退行性疾病模型:如阿尔茨海默病模型脑组织,检测疾病相关基因表达变化,样本需匹配病理分期与对照组以减少偏差。

小鼠免疫细胞:分离自脾脏或淋巴结的淋巴细胞、巨噬细胞等,用于免疫应答基因研究,细胞纯度需通过流式分选验证以保证检测特异性。

小鼠转基因模型组织:特定基因过表达或敲除模型的组织样本,验证基因操作效果,需设计特异性引物区分内源与外源表达。

小鼠胚胎发育阶段样本:不同 gestation 天数的胚胎组织,研究发育动态表达谱,取样需精确计时并避免母体组织污染。

小鼠药物处理模型样本:经化合物处理的组织或细胞样本,评估药物对基因表达的影响,需设置溶剂对照组并控制处理时间一致性。

检测标准

ISO 20395:2019 生物技术-核酸定量方法要求:规定核酸定量分析中的方法验证、校准与控制要求,适用于基因表达检测中RNA与cDNA的定量准确性评估,确保数据可比性。

GB/T 37871-2019 生物样品中核酸提取纯化方法通则:中国国家标准规范生物样本RNA提取流程,包括样本保存、裂解条件与纯度指标,为小鼠组织RNA制备提供技术依据。

MIQE指南(最小信息 for 发表定量实时PCR实验):国际共识标准,规定qPCR实验设计、操作与报告的最低要求,涵盖引物验证、内参选择与数据标准化,提升结果可靠性。

ISO 20166-1:2018 分子体外诊断检验-测序质量要求:针对RNA测序流程的质量控制标准,涉及文库构建、测序深度与比对率,确保基因表达丰度计算准确。

GB/T 30989-2014 逆转录酶活性检测方法:国家标准规范逆转录酶效率测试程序,用于评估cDNA合成质量,为表达检测提供模板制备依据。

ASTM E2935-2013 实时PCR数据解释指南:提供实时PCR数据分析和报告规范,包括基线设置、Ct值确定与统计学处理,减少分析主观性。

ISO 17025:2017 检测和校准实验室能力通用要求:涵盖基因表达检测实验室的管理体系与技术能力要求,确保检测过程受控与结果可追溯。

检测仪器

实时荧光定量PCR仪:集成温控系统与光学检测模块,实现PCR扩增过程中荧光信号实时监测,通过检测荧光强度变化计算Ct值,用于基因表达相对或绝对定量分析。

分光光度计:利用紫外-可见光吸收原理测量核酸样本在特定波长下的吸光度值,快速评估RNA浓度与纯度,确保样本质量符合下游检测要求。

生物分析仪:基于微流控芯片技术自动化评估RNA完整性指数,通过电泳分离与荧光检测提供RNA质量分数,替代传统凝胶电泳进行样本质检。

微量离心机:提供高速离心力用于样本沉淀、试剂混合或相分离,在RNA提取与纯化步骤中加速液体分离,保证操作效率与一致性。

核酸提取仪:自动化执行样本裂解、结合、洗涤与洗脱步骤,采用磁珠或柱式法纯化RNA,减少人为误差,提高小鼠组织样本处理通量。

数字PCR系统:通过微滴或芯片分区技术将反应体系分割为纳升级单元,进行终点PCR检测,直接计数阳性分区实现无需标准曲线的绝对定量,提升精准度。

检测流程

线上咨询或者拨打咨询电话;

获取样品信息和检测项目;

支付检测费用并签署委托书;

开展实验,获取相关数据资料;

出具检测报告。

北检(北京)检测技术研究院
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