基因测序服务检测

北检院检测中心  |  完成测试:  |  2025-10-12  

基因测序服务检测涵盖对测序全流程的质量控制,包括样本制备、文库构建、测序运行和数据分析等环节。检测要点聚焦于准确性、覆盖度、重复性和灵敏度等关键指标,确保数据符合行业规范。所有评估基于标准化方法,以保障测序结果的可靠性和一致性。

注意:因业务调整,暂不接受个人委托测试望见谅。

检测项目

测序准确性检测:通过比对测序数据与参考基因组,计算碱基错误率和一致性百分比,评估测序过程的精确度,确保结果可靠用于下游分析。

覆盖度均匀性检测:评估测序 reads 在目标区域的分布均匀性,避免覆盖不足或过高区域,保证全基因组或靶向测序的数据质量。

数据质量评分检测:基于 Phred 质量值分析测序 reads 的碱基识别可靠性,识别低质量数据区域,为后续过滤和校正提供依据。

重复序列检测:检测测序数据中 PCR 扩增或测序引入的重复 reads,评估文库构建效率,防止重复率过高影响变异调用准确性。

插入片段大小检测:测量文库中 DNA 片段的大小分布,确保片段长度符合实验要求,避免偏差影响测序组装或结构变异分析。

GC 含量偏差检测:分析测序数据中 GC 碱基的比例均匀性,识别测序偏好性,确保不同 GC 含量区域的覆盖度一致。

灵敏度与特异性检测:使用已知变异样本评估检测方法识别真阳性和真阴性的能力,优化变异检测阈值,提高结果可信度。

测序深度检测:计算目标区域的平均测序 reads 数量,确保深度满足检测需求,避免低深度导致假阴性或高深度浪费资源。

链特异性检测:验证链特异性测序中正负链 reads 的分布比例,确保链信息准确用于转录本或甲基化分析。

交叉污染检测:通过空白对照或物种特异性标记评估样本间交叉污染程度,防止污染导致假阳性结果。

检测范围

临床遗传病诊断:应用于遗传变异筛查的测序服务,需检测点突变、插入缺失等,确保结果准确用于疾病风险评估和诊疗决策。

肿瘤基因分型:针对肿瘤样本的体细胞突变检测,涵盖驱动基因和耐药突变,评估测序灵敏度以支持个性化治疗。

微生物组测序:用于环境或人体微生物群落分析,检测物种丰度和多样性,要求高分辨率以区分近缘菌种。

农业育种应用:涉及作物或家畜基因组测序,检测重要性状相关基因,确保数据支持分子标记辅助育种。

法医DNA鉴定:应用于个体识别和亲缘分析,检测STR或SNP位点,要求高重复性和低错误率以保障司法公正。

表观遗传学分析:涵盖DNA甲基化或染色质可及性测序,检测修饰位点的覆盖度和准确性,支持机制研究。

病原体检测:用于病毒或细菌基因组测序,监测变异株和毒力基因,要求快速准确以应对疫情预警。

单细胞测序应用:针对单个细胞的基因组或转录组分析,检测扩增偏倚和捕获效率,确保细胞异质性解析。

代谢组学关联分析:结合基因组与代谢物数据,检测基因-代谢物互作位点,要求多组学数据整合质量。

进化生物学研究:应用于物种比较基因组学,检测系统发育标记和选择信号,支持进化历史推断。

检测标准

ISO 20395:2019《生物技术-测序质量标准要求》:规定了测序数据质量评估的通用要求,包括准确性、覆盖度和重复性指标,适用于各类测序平台的服务验证。

GB/T 30989-2014《高通量测序数据质量评价指南》:中国国家标准,明确了测序数据质量参数的计算方法和阈值,用于服务性能的标准化检测。

ISO 17025:2017《检测和校准实验室能力的通用要求》:国际标准,涵盖测序服务的质量管理体系,确保检测过程的可追溯性和合规性。

GB/T 37872-2019《生物样本测序文库构建质量控制》:针对文库制备环节的检测规范,包括片段大小和浓度评估,防止建库偏差影响测序。

ASTM E3133-2018《测序数据比对准确性标准指南》:提供了序列比对算法的评估方法,用于检测映射错误率和一致性,优化数据分析流程。

ISO 15189:2012《医学实验室质量和能力要求》:适用于临床测序服务,强调检测结果的医学有效性和报告规范性。

GB/T 35826-2018《临床基因测序数据质量控制》:中国标准,规定临床测序数据的敏感性和特异性检测要求,保障诊断安全性。

检测仪器

高通量测序仪:采用边合成边测序原理,通量可达每运行数亿 reads,用于生成原始测序数据,是检测核心设备,支持全基因组或靶向测序。

荧光定量PCR仪:通过荧光信号定量DNA模板浓度,检测文库质量和测序前样本量,确保输入材料符合标准要求。

生物分析仪:利用微流体芯片分析DNA片段大小分布,检测文库片段化效率,防止建库偏差影响测序性能。

数据质控软件:集成FastQC等工具,自动计算质量值、GC含量等参数,用于原始数据质量评估和过滤。

比对分析系统:基于BWA或Bowtie算法,将测序 reads 映射到参考基因组,检测比对率和覆盖度,支持变异调用准确性验证。

检测流程

线上咨询或者拨打咨询电话;

获取样品信息和检测项目;

支付检测费用并签署委托书;

开展实验,获取相关数据资料;

出具检测报告。

北检(北京)检测技术研究院
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