扫描仪微卫星不稳定性检测

检测项目

BAT-25位点分析：检测位于DNA聚合酶δ基因上的单核苷酸重复序列，是MSI检测的核心标志物之一，具有高度敏感性。

BAT-26位点分析：检测位于hMSH2基因上的单核苷酸重复序列，在结直肠癌等肿瘤中表现出高频的不稳定性。

NR-21位点分析：检测位于SLC7A8基因启动子区的单核苷酸重复序列，是国际共识中推荐的五种标志物之一。

NR-24位点分析：检测位于锌指蛋白基因上的单核苷酸重复序列，用于增加MSI检测的特异性和准确性。

MONO-27位点分析：检测位于Caspase-2基因上的单核苷酸重复序列，作为补充标志物，完善MSI状态判定。

D2S123位点分析：检测位于2号染色体上的双核苷酸重复序列，是传统的MSI检测标志物之一。

D5S346位点分析：检测位于5号染色体APC基因附近的双核苷酸重复序列，常用于林奇综合征筛查。

D17S250位点分析：检测位于17号染色体上的双核苷酸重复序列，是经典的Bethesda panel组成部分。

MSI状态判定：基于多个微卫星位点的检测结果，综合计算并判定为微卫星高度不稳定、低度不稳定或稳定。

肿瘤突变负荷间接评估：通过MSI-H状态间接提示高肿瘤突变负荷，为免疫治疗提供参考依据。

检测范围

结直肠癌：MSI检测的首要应用领域，用于林奇综合征筛查、预后判断及指导免疫治疗。

子宫内膜癌：是林奇综合征相关的常见肠外肿瘤，MSI检测对于其病因诊断和风险分层至关重要。

胃癌：部分胃癌尤其是肠型胃癌中存在MSI-H亚型，该亚型具有独特的临床病理特征和预后。

小肠腺癌：林奇综合征相关肿瘤之一，MSI检测有助于识别遗传性病例并进行家族风险管理。

皮脂腺肿瘤：与Muir-Torre综合征相关，MSI检测可作为该综合征的分子诊断依据。

卵巢癌：尤其是子宫内膜样癌和透明细胞癌，MSI检测对病因探究和治疗选择有参考价值。

前列腺癌：少数前列腺癌病例存在MSI-H，可能与特定基因突变和疾病进展有关。

胰腺癌：用于识别罕见的MSI-H亚型，该亚型患者可能从免疫检查点抑制剂治疗中获益。

胆道系统肿瘤：MSI检测有助于探索其分子分型，并为晚期患者寻找潜在的治疗机会。

泛癌种筛查：随着精准医疗发展，MSI检测已作为实体瘤的通用生物标志物进行广泛筛查。

检测方法

荧光多重PCR-毛细管电泳法：金标准方法，通过PCR扩增特定微卫星位点，经毛细管电泳分离并分析片段大小。

下一代测序法：基于NGS平台，通过大Panel或全外显子组测序，一次性评估大量微卫星位点及伴随基因突变。

免疫组织化学法：检测错配修复蛋白的表达缺失，间接推断MSI状态，操作简便、成本较低。

单分子分子倒位探针技术：一种高通量、高灵敏度的NGS衍生技术，可精准检测微卫星序列的长度变化。

数字PCR技术：能够绝对定量，用于检测低频的MSI事件或监测循环肿瘤DNA中的MSI状态。

片段分析软件分析：专用于分析毛细管电泳原始数据，通过比对肿瘤与正常组织的峰图进行自动化判读。

生物信息学分析流程：针对NGS数据，使用如MSIsensor、MANTIS等专用算法进行MSI状态的生物信息学判定。

多重连接依赖性探针扩增技术：可用于检测MLH1、MSH2等MMR基因的拷贝数变异，辅助MSI病因诊断。

微卫星稳定性分型：通过比较多个位点的电泳图谱，将结果标准化为MSS、MSI-L或MSI-H三种类型。

肿瘤细胞富集与DNA提取：关键的前处理步骤，通常需要对福尔马林固定石蜡包埋组织进行显微切割以确保DNA质量。

检测仪器设备

基因分析仪：进行毛细管电泳的核心设备，如ABI 3500系列，用于分离和检测荧光标记的PCR产物。

高通量测序仪：如Illumina NovaSeq、MiSeq或Ion Torrent系统，用于进行基于NGS的MSI检测。

实时荧光定量PCR仪：用于常规PCR扩增或数字PCR反应，是样本制备和预扩增的关键设备。

数字PCR系统：如Bio-Rad QX200系统，提供高精度的绝对定量分析，适用于低丰度样本检测。

全自动核酸提取仪：从组织样本中高效、标准化地提取高质量基因组DNA，确保检测结果的可靠性。

显微切割系统：如激光捕获显微切割系统，用于从病理切片中精确分离肿瘤细胞区域，避免正常细胞污染。

生物分析仪或片段分析仪：如Agilent 2100，用于评估提取DNA或PCR产物的质量和浓度。

高性能计算服务器：存储和处理海量NGS测序数据，运行复杂的生物信息学分析流程。

自动电泳上样仪：与基因分析仪配套使用，实现样本的自动化、高通量上样，提高检测效率。

专业数据分析软件：如GeneMapper、MSI-Caller等，专门用于微卫星片段的分析、比对和结果判读。

检测流程

线上咨询或者拨打咨询电话;

获取样品信息和检测项目;

支付检测费用并签署委托书;

开展实验，获取相关数据资料;

出具检测报告。