溶液构象核磁检测

北检院检测中心  |  完成测试:  |  2026-05-20  

本检测详细介绍了溶液构象核磁检测技术,涵盖其核心检测项目、广泛的应用范围、关键实验方法以及主要仪器设备。本检测旨在为从事生物化学、药物研发和结构生物学的研究人员提供一份全面的技术参考,深入解析核磁共振技术在解析生物大分子动态三维结构中的核心作用。

注意:因业务调整,暂不接受个人委托测试望见谅。

检测项目

化学位移归属:指认蛋白质、核酸等生物大分子中每个原子核(如1H, 15N, 13C)在NMR谱图中的具体峰位,是后续所有分析的基础。

二级结构鉴定:通过分析化学位移指数、耦合常数等参数,确定分子中α-螺旋、β-折叠、转角和无规卷曲等二级结构元件的组成与位置。

三级结构计算:利用核磁共振实验获得的距离和角度约束(如NOE、RDC),通过计算模拟确定生物大分子的三维空间折叠方式。

主链动力学分析:通过测量15N弛豫参数(T1, T2, NOE),研究蛋白质主链在皮秒到纳秒时间尺度上的局部柔性运动。

侧链构象与旋转:分析侧链质子间的NOE信号及弛豫数据,确定氨基酸侧链的构象(如χ1角)及其运动特性。

蛋白质折叠/去折叠研究:监测化学位移、峰强度等随变性条件(如温度、pH、变性剂)的变化,研究蛋白质的折叠稳定性与去折叠过程。

分子间相互作用界面:通过化学位移扰动、界面交叉饱和转移等技术,确定蛋白质-蛋白质、蛋白质-小分子配体相互作用的结合位点。

氢键网络确定:利用氢/氘交换实验及长程NOE信号,识别和确认分子内或分子间形成的氢键,对稳定结构至关重要。

顺磁性探针约束:通过引入顺磁性标签产生伪接触化学位移或顺磁弛豫增强,获得长程距离和取向信息,辅助大分子或复合物结构解析。

构象交换过程监测:利用CPMG弛豫色散或化学交换饱和转移实验,探测微秒到毫秒时间尺度的构象变化或相互作用过程。

检测范围

可溶性蛋白质:适用于分子量通常在40 kDa以下(借助新技术可达1 MDa)的单体或寡聚可溶性蛋白质的结构与动力学研究。

多肽及环肽:用于测定具有生物活性的短肽、环肽在溶液中的优势构象,常用于药物先导化合物设计。

核酸分子:包括DNA、RNA及其修饰形式,研究其二级结构(如双螺旋、发夹、四链体)、三级折叠以及与蛋白质的识别。

蛋白质-核酸复合物:解析转录因子与DNA、核糖体蛋白与RNA等复合物的结构、动力学及相互作用细节。

糖类与糖复合物:研究寡糖、多糖的构象,以及糖蛋白中糖链的结构及其与蛋白质的相互作用模式。

膜蛋白模拟体系:在模拟膜环境的胶束、纳米盘或双亲性聚合物中,研究膜蛋白的溶液构象与功能机制。

内在无序蛋白质:研究缺乏固定三级结构的IDPs在溶液中的构象系综、局部结构倾向性及与配体结合时的构象选择。

药物小分子及其复合物:确定小分子药物的构象,并研究其与靶标蛋白结合后的构象变化、结合常数和结合模式。

金属蛋白与辅因子:研究含有金属离子(如Zn, Fe, Mg)或辅酶(如血红素)的蛋白质中,金属/辅因子的配位环境及对整体结构的影响。

病毒衣壳蛋白与组装体:用于研究病毒颗粒的亚基结构、组装中间体及动力学过程,通常在非感染性片段或亚复合物水平进行。

检测方法

二维同核/异核相关谱:如1H-1H COSY, TOCSY, NOESY以及1H-15N HSQC, 1H-13C HSQC等,用于化学位移归属和识别通过化学键或空间的关联。

核奥弗豪泽效应谱:NOESY是溶液NMR结构测定的基石,通过空间接近(通常< 5Å)的核之间的交叉峰提供距离约束。

弛豫测量:包括15N/13C的T1、T2弛豫时间和异核NOE的测量,用于定量分析分子在多个时间尺度上的动力学行为。

残余偶极耦合:RDC测量部分定向样品中核间偶极耦合的残余值,提供远程的取向约束,极大提高结构精度和域间取向信息。

氢氘交换实验:通过监测主链酰胺质子在D2O中的交换速率,推断氢键保护程度和蛋白质折叠核心,以及研究动态变化。

顺磁核磁共振:利用顺磁中心产生的PRE、PCS或RDC效应,获得长距离(可达40Å)的结构和动力学信息,特别适用于大分子体系。

化学位移扰动:通过比较结合配体前后蛋白质特征谱峰(如HSQC)的化学位移变化,快速筛选和定位相互作用界面。

交叉饱和转移:通过选择性饱和配体或蛋白质一方的信号,观察磁化转移至另一方,直接鉴定处于结合界面的残基。

弛豫色散实验:CPMG型弛豫色散实验可探测微秒到毫秒时间尺度的低丰度激发态构象或化学交换过程。

固态NMR兼容的溶液方法:如用于研究非晶聚集物或弱溶性复合物的快速魔角旋转相关技术,是传统溶液NMR的补充。

检测仪器设备

高场超导核磁共振谱仪:核心设备,磁场强度通常为500 MHz至1.2 GHz及以上,高磁场提供高分辨率和灵敏度。

低温探头:将射频线圈和前置放大器冷却至低温(~20K),显著降低电子学噪声,提高检测灵敏度,尤其适用于生物样品。

三共振探头:可同时对1H, 13C, 15N三种核进行激发和检测,是进行生物大分子多维异核NMR实验的标准配置。

带Z-梯度的脉冲场梯度单元:用于相干路径选择、水峰压制、扩散测量和RDC实验中的样品定向,是现代NMR谱仪的关键部件。

自动样品更换器:实现多个样品的自动、连续测量,大幅提高通量,适用于筛选实验或需要长时间累积数据的应用。

温度控制系统:精密控制样品温度,范围通常在0°C至80°C,用于研究温度依赖的构象变化、折叠及动力学过程。

氘锁通道与匀场系统:氘锁通道用于稳定磁场,自动或手动匀场系统用于优化磁场均匀性,以获得高分辨率谱图。

数据采集与处理工作站:配备专业NMR控制软件(如TopSpin)和数据处理软件,用于实验设置、数据采集、傅里叶变换和相位调整。

结构计算与分析软件:如CYANA, XPLOR-NIH, AMBER等,利用NMR实验约束进行三维结构计算、优化和验证。

辅助样品制备设备:包括用于同位素标记的生物反应器、高效液相色谱、超滤浓缩仪等,确保获得高纯度、高浓度的稳定样品。

检测流程

线上咨询或者拨打咨询电话;

获取样品信息和检测项目;

支付检测费用并签署委托书;

开展实验,获取相关数据资料;

出具检测报告。

北检(北京)检测技术研究院
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