小rna测序数据分析检测

检测项目

序列读数质量控制：评估原始FASTQ文件质量，参数包括Q30分数≥85%、Phred分数分布分析和序列长度偏差≤5%。

比对率检测：计算序列与参考基因组的匹配比例，参数设定比对效率≥90%、错误匹配率<0.01%和软硬剪辑位点统计。

表达丰度量化：采用FPKM或TPM方法度量小RNA表达水平，参数包括动态范围1e-5~1e5、重复样本一致性R²>0.95和标准化系数计算。

差异性表达分析：识别组间差异小RNA，参数涉及p值<0.05、fold change阈值≥2倍和Benjamini-Hochberg校正FDR≤0.05。

序列错误率估算：检测测序过程中的碱基错误，参数包括错误率≤0.1%、插入缺失比率<0.01%和GC偏倚分析。

新型小RNA预测验证：评估预测算法的准确性，参数涵盖敏感度≥95%、特异度>90%和保守区域比对得分≥80。

靶基因功能富集：分析小RNA调控通路，参数包括KEGG富集p值<0.01、GO术语覆盖率和富集因子≥2。

样本间相关性评估：计算样本重复性指标，参数涉及Pearson相关系数>0.9、组内方差<10%和PCA主成分贡献分析。

miRNA成熟体比例检测：量化成熟miRNA与pre-miRNA比例，参数设定比值范围0.7~1.0、稳定性指数>0.8和剪切位点覆盖率。

序列复制水平监控：识别PCR扩增偏差，参数包括重复序列比例<20%、低复杂度区域过滤和唯一分子标识符计数。

小RNA长度分布分析：评估片段大小集中度，参数涵盖长度峰值21~23nt、标准差≤1.5nt和异常片段剔除阈值。

数据完整性验证：检查文件完整性和格式合规，参数包括FASTQ格式错误率=0、文件大小匹配度和MD5校验和验证。

检测范围

人类血液样本：用于疾病标记物发现如癌症miRNA表达谱分析，支持液体活检应用。

植物组织样本：研究胁迫响应机制如干旱条件下小RNA动态变化，适用于作物育种。

癌症组织活检：分析肿瘤微环境中miRNA差异性表达，助力精准医疗诊断。

病毒感染的细胞培养：检测病毒衍生小RNA如siRNA丰度，评估感染进程和治疗效果。

微生物宏转录组样本：探究群落中小RNA多样性，应用于环境监测和益生菌研究。

药物处理细胞样本：量化药效相关miRNA变化，支持药物开发毒性评估。

发育阶段组织样本：研究时序性小RNA表达模式如胚胎发育过程，用于基础生物学。

转基因生物标本：验证基因编辑对小RNA表达的影响，应用于生物工程验证。

环境污染物暴露样本：分析化学污染物诱导的小RNA调控机制，支持生态风险评价。

临床诊断样本：筛查疾病特异性miRNA标志物如神经退行性疾病，用于早期检测。

动物模型组织：评估模型可靠性如小鼠miRNA表达模拟人类病理，支持转化医学。

食品基质样本：检测食源性病原体小RNA表达，应用于食品安全监控。

检测标准

ISO 20395:2019生物技术高通量测序数据质量评估指标规范。

GB/T 30901-2014生物信息学分析流程标准化准则。

ASTM E3143-18测序数据分析验证方法通用指南。

ISO/IEC 17025:2017测试和校准实验室能力要求。

GB/T 37871-2019高通量测序数据质量控制技术规范。

EN ISO 15189:2012医学实验室质量和能力专用要求。

ISO 5725-2:2019测量方法与结果准确度评估标准。

GB/T 19001-2016质量管理体系要求。

ISO 9001:2015质量管理体系基础和术语。

ASTM WK65028小RNA测序数据差异性分析草案。

检测仪器

高通量测序仪：用于生成小RNA测序原始数据，功能包括双端读数输出和碱基调用校准。

序列比对软件：执行序列与参考基因组匹配，功能涉及快速比对算法和错误校正模块。

质量控制分析工具：评估原始数据完整性，功能包括质量分数分布可视化和异常读数过滤。

表达量化系统：计算小RNA丰度指标，功能支持标准化处理和多样本比较分析。

差异性分析平台：识别显著性差异表达，功能整合统计模型和多重检验校正算法。

预测验证软件：验证新型小RNA准确性，功能涵盖保守性评分和结构预测引擎。

功能富集计算器：执行通路富集分析，功能包括数据库集成和富集p值计算。

检测流程

线上咨询或者拨打咨询电话;

获取样品信息和检测项目;

支付检测费用并签署委托书;

开展实验，获取相关数据资料;

出具检测报告。