单细胞全基因组测序检测

北检院检测中心  |  完成测试:  |  2025-07-01  

单细胞全基因组测序检测通过分离单个细胞进行高通量测序,实现细胞异质性研究。核心检测包括基因组覆盖深度、变异检出限、文库构建质量等参数控制,应用于肿瘤进化、生殖医学和神经科学领域。检测过程需遵循严格的核酸提取与扩增标准。

注意:因业务调整,暂不接受个人委托测试望见谅。

检测项目

基因组覆盖深度:目标区域≥30X覆盖比例,检测全基因组均一性

单核苷酸变异(SNV)检测:灵敏度达等位基因频率0.1%,支持低频突变分析

拷贝数变异(CNV)分析:分辨率5kb,检测染色体片段重复/缺失

结构变异(SV)筛查:支持>50bp插入/缺失及易位事件识别

线粒体基因组测序:覆盖线粒体DNA 16.5kb全序列,变异识别精度99.5%

文库浓度定量:Qubit检测范围0.05-100ng/μl,CV值≤5%

片段分布检测:Agilent 2100分析200-1000bp片段,主峰偏差±15bp

基因组完整性:DV200值≥50%,评估核酸降解程度

交叉污染控制:样本间SNP一致性≤0.01%

扩增偏倚评估:全基因组GC覆盖率偏差≤15%

嵌合体检测:识别非配对reads连接错误率<0.1%

端粒序列覆盖:端粒区域覆盖率≥85%

检测范围

循环肿瘤细胞(CTC):10mL外周血中≥5个细胞的基因组变异检测

胚胎植入前诊断:单个卵裂球细胞非整倍体筛查

神经元亚型分型:脑组织单细胞基因组异质性研究

造血干细胞克隆演化:骨髓样本克隆起源追踪

植物原生质体:作物单细胞抗性基因检测

微生物单细胞:不可培养微生物基因组组装

免疫细胞受体:TCR/BCR多样性分析

古生物化石:微量DNA降解样本处理

器官发育研究:胚胎组织细胞谱系追踪

病毒整合位点:宿主细胞病毒基因组定位

肿瘤微环境:肿瘤组织空间转录组关联分析

生殖细胞突变:配子体新生突变检测

检测标准

ISO/IEC 17025:2017 检测实验室通用要求

ISO 20395:2018 核酸检测方法验证规范

GB/T 37872-2019 高通量测序数据质量控制

CLSI MM19-A2 测序检测体系验证指南

GB/T 30989-2014 核酸浓度测定分光光度法

EN ISO 18115:2022 基因组学术语国际标准

GB/T 34796-2017 单细胞分离操作规范

ISO 20387:2018 生物样本库通用要求

YY/T 1723-2020 测序用文库质控指南

GB/T 29889-2013 人类基因检测样本采集要求

检测仪器

激光捕获显微切割系统:实现组织切片中特定细胞分离,定位精度1μm

微流控分选平台:完成单细胞捕获与封装,通量≥10,000细胞/小时

全自动核酸提取仪:微量样本处理能力0.1-10ng DNA回收率≥85%

多重置换扩增系统:全基因组扩增覆盖度>95%,扩增偏倚<20%

高通量测序仪:单次运行产出≥6Tb数据,读长2x150bp

生物分析仪:检测DNA片段分布,灵敏度0.5ng/μl

数字PCR系统:绝对定量检测文库浓度,精度±5%

超低温储存系统:-150℃样本保存,温度波动±3℃

自动化移液工作站:纳升级液体处理精度CV≤2%

生物信息分析集群:计算节点≥256核,存储容量≥2PB

检测流程

线上咨询或者拨打咨询电话;

获取样品信息和检测项目;

支付检测费用并签署委托书;

开展实验,获取相关数据资料;

出具检测报告。

北检(北京)检测技术研究院
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