rna测序检测

检测项目

RNA完整性检测：通过电泳或微流体系统评估RIN值（范围1-10），确保样本质量满足测序要求。

RNA浓度测量：使用分光光度法测定A260/A280比值（目标范围1.8-2.0），计算精确浓度为后续步骤提供基础。

rRNA去除效率评估：分析残余rRNA比例（阈值<5%），优化去除流程以减少干扰。

cDNA文库大小分布检测：片段分析确定峰值区间（标准200-500bp），保证文库均一性。

测序数据质量控管：计算Q30值（要求≥80%），评估碱基读取精度。

测序深度调控：设定平均覆盖深度（目标30x），确保数据完整性。

基因表达量化：基于RPKM/FPKM方法（范围0-1000），计算转录本丰度。

差异表达分析：应用log2 fold change阈值（±1.5），识别显著表达变化。

SNP检测：测定变异等位基因频率（>10%），调用单核苷酸多态性。

融合基因鉴定：验证支持读取数（阈值>5），确认基因重组事件。

转录本拼接准确性：计算N50值（目标>1000bp），评估组装质量。

RNA甲基化分析：检测m6A修饰位点（覆盖率>90%），研究表观遗传调控。

表达谱稳定性检验：通过系数变异（CV<0.15），确保技术重复性。

序列比对率评估：比对参考基因组的比例（目标>90%），验证数据有效性。

批次效应校正：使用标准化因子（如TMM），消除实验偏差。

检测范围

人类组织样本：包括肿瘤、脑部或心脏组织，用于疾病机制研究和诊断标志物挖掘。

植物材料：如玉米叶片或水稻根系，支持作物改良和胁迫响应分析。

微生物样本：涵盖细菌培养物和病毒RNA，应用于病原体检测和抗菌研究。

细胞培养物：例如干细胞或癌细胞系，用于体外药物筛选和基因功能探索。

血液样本：全血或血浆RNA，实现液体活检在癌症早期筛查中的应用。

肿瘤组织：实体瘤或转移灶样本，推进个性化医疗和靶向治疗评估。

发育生物学样本：胚胎或胎儿组织，构建时空表达图谱。

环境样本：土壤或水体宏转录组，监测微生物群落动态。

法医样本：唾液或头发RNA，用于身份鉴定和刑侦溯源。

药物处理细胞：暴露于化合物的细胞系，评估毒性和药效响应。

昆虫样本：如蚊虫或果蝇，支持进化生物学和病虫害防控。

临床体液样本：尿液或脑脊液RNA，开发无创诊断工具。

古生物样本：化石或保存组织，用于古基因组学重建。

合成RNA标准品：作为质量控制参考，校准实验流程。

检测标准

ISO 20395:2019 - 生物技术领域RNA测序质量控制规范，涵盖样本处理和数据分析。

GB/T 37876-2019 - 转录组测序技术规范，规定文库构建和测序操作流程。

ASTM E2721 - 高通量测序应用标准实践，确保测序深度和数据可靠性。

GB/T 33635-2017 - RNA测序数据分析要求，指导变异检测和表达量化。

ISO 15189 - 医学实验室质量和能力标准相关部分，应用于临床样本检测。

EN ISO 17025 - 检测实验室通用能力要求，覆盖仪器校准和方法验证。

GB/T 30982 - 生物样本测序质量控制标准，设定完整性指标阈值。

ISO 17034 - 标准物质生产规范，用于RNA参考物质制备。

GB/T 27502 - 分子生物学检测通用指南，支持实验设计和报告生成。

ISO 10993 - 医疗器械生物学评价相关部分，适用于体外诊断样本。

检测仪器

高通量测序仪：执行大规模平行测序，生成原始序列数据用于变异分析。

生物分析仪：评估RNA完整性（RIN值）和文库片段大小分布。

实时荧光定量PCR系统：验证基因表达水平，提供辅助定量依据。

核酸定量设备：测量RNA浓度和纯度（A260/A280比值），确保样本质量。

自动化液体处理工作站：加速文库构建过程，减少人工误差。

计算服务器集群：处理大规模测序数据，运行比对和表达分析算法。

电泳系统：可视化RNA完整性，辅助RIN值计算。

文库制备试剂盒：标准化cDNA合成步骤，保证流程一致性。

低温存储设备：保存样本和试剂，维持RNA稳定性。

数据分析软件套件：执行生物信息学分析，包括差异表达和拼接验证。

检测流程

线上咨询或者拨打咨询电话;

获取样品信息和检测项目;

支付检测费用并签署委托书;

开展实验，获取相关数据资料;

出具检测报告。